期刊文章详细信息
藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析
Identification and expression analysis of GRF transcription factor family of Chenopodium quinoa
文献类型:期刊文章
SHI Pi-Biao;HE Bing;FEI Yue-Yue;WANG Jun;WANG Wei-Yi;WEI Fu-You;LYU Yuan-Da;GU Min-Feng(Xinyang Agricultural Experiment Station of Yancheng City,Yancheng 224049,Jiangsu,China;Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210014,Jiangsu,China)
机构地区:[1]盐城市新洋农业试验站,江苏盐城224049 [2]江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所,江苏南京210014
基 金:江苏现代农业(蔬菜)产业技术体系(盐城)推广示范基地项目(JATS(2018)137);江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2015)资助~~
年 份:2019
卷 号:45
期 号:12
起止页码:1841-1850
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:生长调控因子(growth-regulating factor,GRF)是植物特有的一类转录因子,对植物的生长发育起重要的调控作用。藜麦是一种单体植物即可满足人体基本营养需求的食物,也是未来最具潜力的农作物之一。但是关于藜麦GRF基因家族的研究至今尚缺乏报道。因此,本研究利用生物信息学方法,对藜麦GRF基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统发育关系及组织表达进行分析。结果表明,藜麦中共有18个GRF转录因子,蛋白长度77~621 aa,分子量8.81~67.38 kD,等电点5.23~9.37;每个成员含有1~4个内含子及2~5个外显子,这些GRF蛋白都具有由31~35个氨基酸组成的QLQ保守结构域或由25~43个氨基酸组成的WRC保守结构域。系统进化分析表明,藜麦与拟南芥的GRF转录因子亲缘关系比水稻更近。表达图谱显示,藜麦GRF基因具有明显的组织表达特异性,总体在种子中的表达量较高,其次是在花序和根中,在其他组织中的表达量相对较低。
关 键 词:藜麦 GRF转录因子 进化分析 表达分析
分 类 号:R73]
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