期刊文章详细信息
阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶点的生物信息学分析
Bioinformatic analysis of direct protein targets of aspirin against human breast cancer proliferation
文献类型:期刊文章
ZHU Xingmei;YANG Jiani;ZHANG Enhu;QIAO Wei;LI Xuejun(Department of Pharmacology,Shaanxi University of Chinese Medicine;Key Laboratory of Pharmacodynamics and Material Basis of Chinese Medicine of Shaanxi Administration of Traditional Chinese Medicine;Shaanxi Key Laboratory of Traditional Medicine Foundation and New Drug Research,Xianyang 712046,China;Department of Gastroenterology,521 Hospital of Norinco Group,Shaanxi,Xi'an,710065,China;School of Basic Medicine,Peking University Health Science Center,Beijing,100191,China)
机构地区:[1]陕西中医药大学药学院药理学教研室 [2]陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室 [3]陕西省中药基础与新药研究重点实验室,陕西咸阳712046 [4]中国兵器工业五二一医院,陕西西安710065 [5]北京大学医学部药理学系,北京100191
基 金:国家自然科学基金(81402186);陕西省自然科学基金青年基金(2019JQ-878);陕西中医药大学青年基金(2015QN18)~~
年 份:2019
卷 号:39
期 号:10
起止页码:1141-1148
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的基于生物信息学分析大量公共数据库,探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白(DPTs),STRING在线构建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和信号通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突变,并利用OncoPrint可视化;从TCGA数据库下载乳腺癌与正常组织中的转录组数据,利用DECenter分析差异过表达基因,对STRING分析得到的DPTs相互关联基因与TCGA中的差异过表达基因求交集,确认阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,并利用Gene Ontology进行GO功能富集分析。最终通过蛋白免疫印迹实验验证阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点。结果搜索Drug Bank 5.1.3确定了11个阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6个DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)与癌症发生发展有关。通过分析TCGA数据库中乳腺癌与正常组织中的转录组数据获得10220个过表达差异基因,与STRING分析得到的6个阿司匹林DPTs的相互关联基因求交集,发现4个基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其基因功能主要富集于细胞周期与细胞分裂。蛋白免疫印迹实验结果显示:阿司匹林可以降低人乳腺癌细胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表达。结论CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其可能通过影响细胞周期和细胞分裂发挥抗肿瘤增殖作用。
关 键 词:阿司匹林 人乳腺癌 生物信息学 细胞周期 细胞分裂
分 类 号:R73]
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