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期刊文章详细信息

肠道微生物功能宏基因组学与代谢组学关联分析方法研究进展    

Advances in research on association analysis methods between gut functional metagenomics and metabolomics

  

文献类型:期刊文章

作  者:侯璐文[1] 吴长新[2,3] 秦雪梅[1,3] 李建国[2,3]

Luwen Hou;Changxin Wu;Xuemei Qin;Jianguo Li(Modern Research Center for Traditional Chinese Medicine,Shanxi University,Taiyuan 030006,Shanxi Province,China;Institutes of Biomedical Sciences,Shanxi University,Taiyuan 030006,Shanxi Province,China;Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering,Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,Shanxi Province,China)

机构地区:[1]山西大学中医药现代研究中心,山西太原030006 [2]山西大学生物医学研究院,山西太原030006 [3]山西大学化学生物学与分子工程教育部重点实验室,山西太原030006

出  处:《微生物学报》

基  金:国家自然科学基金(81301441);国家科技重大专项(2018ZX10305409);山西省软科学研究计划(2018041031-2)~~

年  份:2019

卷  号:59

期  号:9

起止页码:1813-1822

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:近年来基于高通量基因测序的微生物组学研究极大加深了人们对微生物与健康和疾病关系的认识。然而基因测序方法不能直接测定微生物的功能活性,难以鉴定微生物中的关键功能分子,单独使用无法回答肠道微生物何种成员通过何种方式影响宿主等关键科学问题。单一组学研究弊端尽显,多组学联用势在必行。肠道微生物代谢组学以微生物群落所有小分子代谢物为研究对象,可发现肠道微生物随宿主病理生理变化的关键代谢物,为微生物组-宿主互作机制研究提供线索,成为微生物组学研究的重要补充。肠道微生物功能基因组学与代谢组学关联分析在宿主生理、疾病病理、药物药理等方面取得众多进展,展现良好应用前景。然而目前肠道微生物功能基因组学与代谢组学关联分析存在方法滥用、相关性结论与生物学知识相悖等突出问题。为帮助正确应用肠道微生物功能宏基因组学与代谢组学关联分析,本文综述了各种多组学数据整合分析方法的原理、优缺点与适用范围,并给出了应用建议。

关 键 词:肠道微生物 功能宏基因组学  代谢组学 多组学关联分析  

分 类 号:R73]

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