期刊文章详细信息
HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析
Comparison of HCV genotypes in patients with HIV/HCV co-infection and HCV mono-infection in Guangzhou
文献类型:期刊文章
Deng Haohui;Li Xiaoqiang;Gao Hongbo(Department of Liver Diseases,Eighth People's Hospital,Affiliated to Guangzhou Medical University,Guangzhou 510060,Guangdong Province,China)
机构地区:[1]广州医科大学附属市八人民医院重症肝病科,广州市510060 [2]广州医科大学附属市八人民医院传染病研究所,广州市510060
基 金:广州市卫生健康科技项目(编号:20191A011037);广州市科信局科技惠民专项(编号:2014Y2-00149)
年 份:2019
卷 号:22
期 号:5
起止页码:656-659
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7%对19.6%P<0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6%对3.2%P<0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689)reads,HCV感染者为(14323±5321)reads,两组无显著差异(P>0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467)reads,HCV感染者为(17611±5632)reads,也无显著差异(P>0.05);本组228例(97.9%)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0%对59.4%,P<0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1%)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。
关 键 词:慢性丙型肝炎 艾滋病 HCV基因型 二代测序
分 类 号:R51]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...