文献类型：期刊文章

作　　者：惠甜[1,2] 沈兵琪[1,2] 王连春[1,2] 卜晓真[1,2] 邓浪[1,2] 包昌艳[1,2] 周凡[1,2] 李辰晖[1,2]

Hui Tian;Shen Bingqi;Wang Lianchun;Bu Xiaozhen;Deng Lang;Bao Changyan;Zhou Fan;Li Chenhui(Key Laboratory of Biodiversity Conservation of the State Forestry Administration of Southwest China,College of Forestry,Southwest Forestry University,Kunming,650244;Key laboratory for Forest Resources Conservation and Use in the Southwest Mountains of Education,Southwest Forestry University,Kunming,650244)

机构地区：[1]西南林业大学林学院,西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,昆明650224 [2]西南林业大学,西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室,昆明650224

出　　处：《分子植物育种》

基　　金：云南森林资源培育与利用协同创新中心及林业公益性行业科研专项(201304810)资助

年　　份：2019

卷　　号：17

期　　号：17

起止页码：5624-5637

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：本研究旨在鉴定桑树bHLH基因,并分析预测其理化性质和保守结构域,以期为研究bHLH转录因子在桑树的生长发育、抗逆胁迫以及信号转导过程中的作用提供参考。本研究使用桑树全基因组数据,通过生物信息学方法对桑树的b HLH转录因子进行了鉴定与系统分析。结果表明,在桑树全基因组中共鉴定出173个b HLH转录因子,经过系统进化分析,将其分为四个进化大组,11个亚组;bHLH转录因子间理化性质差别和跨度较大,59.1%的等电点小于7,呈弱酸性;保守结构域分析表明,bHLH转录因子有两个高度保守的结构域并含有H5-E9-R13保守序列,N端的碱性氨基酸区与DNA结合位点有关,C端的HLH区形成螺旋-环-螺旋结构并且与形成二聚体有关,共含有5种保守元件;保守元件分析表明,bHLH基因家族只含有一个HLH保守结构域结构;蛋白互作分析结果表明,相似的功能或者相近的生理过程可能由不同的蛋白控制。鉴定和分析桑树bHLH转录因子家族,既可以为桑树的抗旱、胁迫等方面的研究提供分子生物学理论基础,又可以为分子改良桑树品种提供理论依据,从而改良桑椹的果实品质,进一步提高桑椹的食用价值和药用价值。

关 键 词：桑树(Morus  notabilis)  bHLH转录因子  生物信息学分析 全基因组鉴定  蛋白质互作  

分 类 号：Q943.2[植物生产类] S888.3]