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水稻氮高效利用基因NRT1.1B InDel分子标记的开发与应用
Development and Application of InDel Marker for High Nitrogen-use Efficiency Gene NRT1.1B in Rice
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]浙江省嘉兴市农业科学研究院(所),嘉兴314016
基 金:浙江省科技计划项目(2016C32104)资助
年 份:2016
卷 号:14
期 号:12
起止页码:3405-3413
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:水稻NRT1.1B基因是已经克隆并进行功能验证的氮高效利用基因,具有很高的应用价值。根据籼粳稻NRT1.1B基因的基因组序列比对发现,籼型NRT1.1B基因及粳型NRT1.1B基因内含子序列中存在插入/缺失位点。对30个常规籼粳稻的NRT1.1B基因内含子序列进行PCR扩增、测序及序列比对,发现NRT1.1B基因内含子存在6个In Del位点,籼型NRT1.1B基因比粳型NRT1.1B基因缺失55 bp。根据插入/缺失位点设计出In Del分子标记,对15个籼稻常规稻品种、15个粳稻常规稻品种、3个籼粳杂交稻品种及20个F2代育种材料进行NRT1.1B籼粳基因型鉴定。检测实验表明与通过NRT1.1B基因的SNP位点开发的功能标记的检测完全一致。通过该标记可以准确鉴定NRT1.1B基因的纯合籼型、纯合粳型及杂合基因型,该方法成本低、简单、可靠,可用于NRT1.1B基因的鉴定和分子标记辅助育种。
关 键 词:水稻 氮高效利用 NRT1.1B基因 INDEL标记
分 类 号:S511]
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