文献类型：期刊文章

作　　者：曹又方[1] 赵立平[2]

机构地区：[1]山西大学生物技术研究所,山西太原030006 [2]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240

出　　处：《山西大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家高技术研究发展计划项目 ("86 3"项目 ) (NO.SZ- 0 3- 0 1- 0 4 )

年　　份：2002

卷　　号：25

期　　号：4

起止页码：354-357

语　　种：中文

收录情况：AJ、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、普通刊

摘　　要：重复 DNA序列是细菌基因组中的一个重要组成部分 ,而 ERIC(IRU )序列是在肠道细菌基因组中发现的一类基因间重复序列。本研究使用 HMMER软件建立 ERIC序列族的模型 ,并用该模型对 4 6个已测序的菌株进行全基因组序列搜索 ,并对搜索结果进行比较分析 ,找出 ERIC(IRU )序列在不同细菌基因组中的分布规律 ,即 ERIC序列主要存在于肠道细菌中 。

关 键 词：ERIC序列  细菌基因组 ERIC(IRU)序列  HMMER  全基因组序列搜索  重复DNA序列 分布规律  

分 类 号：Q933]