文献类型：期刊文章

作　　者：苏雅静[1] 乔霞[1] 刘学雷[3] 杨宁爱[3] 贾伟[1,2] 赵志军[1,2]

SU Ya-jing;QIAO Xia;LIU Xue-lei;YANG Ning-ai;JIA Wei;ZHAO Zhi-jun(Ningxia Key Laboratory of Clinical and Pathogenic Microbiology,General Hospital of Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China;General Hospital of Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China;Ningxia Medical University, Yinchuan 750004, China)

机构地区：[1]宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室,银川750004 [2]宁夏医科大学总医院医学实验中心,银川750004 [3]宁夏医科大学,银川750004

出　　处：《中国人兽共患病学报》

基　　金：国家自然科学基金(No.81560333);宁夏医科大学校级课题(No.XM2016067)~~

年　　份：2019

卷　　号：35

期　　号：10

起止页码：957-963

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：目的采用生物信息学对ROP16 Ⅰ基因转染的A549细胞株的表达谱芯片结果进行数据挖掘,寻找影响Ⅰ型弓形虫疾病的差异表达基因,为揭示Ⅰ型弓形虫疾病的发病机制提供依据。方法通过生物信息学方法对过表达ROP16 Ⅰ的A549细胞株的表达谱进行研究,从中筛选差异表达基因。将得到的数据导入在线分析工具ToppGene和STRING中对差异表达基因进行筛选,同时进行GO 分析及KEGG分析。结果本研究共获得了483个差异表达基因,其中上调的基因共有252个,下调的基因共有231个。ToppGene最终筛选得到CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等14个Ι型弓形虫相关的基因。GO分析和KEGG分析发现,这些候选基因与白介素IL-10、IL-4、IL-13信号通路,细胞因子-细胞因子受体相互作用通路及Toll样受体信号通路等相关。在蛋白-蛋白互作网络中,这14个候选基因恰好处于网络的最核心位置。结论Ι型弓形虫疾病的发生可能与CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等基因密切相关。

关 键 词：ROP16  弓形虫 表达谱 生物信息

分 类 号：R382.5] R52[基础医学类]