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期刊文章详细信息

基于RNA_Seq技术分析对乙酰氨基酚对斑马鱼转录组的影响    

Analyzing effect of acetaminophen on zebrafish transcriptome through RNA_Seq technique

  

文献类型:期刊文章

作  者:康桂英[1,2] 董武[2] 杨景峰[2] 杨晓野[1]

KANG Gui-ying;DONG Wu;YANG Jing-feng;YANG Xiao-Ye(College of Veterinary Medicine , Inner Mongolia Agricultural University ,Hohhot 010018 ,China;Inner Mongolia Key Laboratary of Toxicant Monitoring and Toxicology ,School of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for the Nationalities,Tongliao,Inner Mongolia 028000,China)

机构地区:[1]内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010018 [2]内蒙古民族大学动物科学技术学院/内蒙古自治区毒物监控及毒理学重点实验室,内蒙古通辽028000

出  处:《中国兽医学报》

基  金:国家自然科学基金资助项目(21267015,81360508,21567019);内蒙古自然科学基金资助项目(2015MS0804);内蒙古科技创新引导资助项目(KJCX15003);草原英才工程资助项目(2017-2020);内蒙古民族大学特色交叉学科群建设资助项目(MDXK008);内蒙古毒物监控及毒理学重点实验室开放课题资助项目(MDK2017012)

年  份:2019

卷  号:39

期  号:10

起止页码:2033-2039

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了研究对乙酰氨基酚对斑马鱼发育影响,采用高通量转录组测序RNA-seq技术对对乙酰氨基酚处理组(CAPAP组)与对照组(CO组)斑马鱼进行检测,以斑马鱼基因(danio rerio assembly version GRCz10)作为参考基因组,对检测结果进行拼接与质量评估,筛选出差异表达基因,并进行GO和Pathway功能分析。荧光定量PCR对部分与肝脏有关的差异表达基因进行验证。结果表明,CO与CAPAP组的差异表达基因数量为72个,其中上调差异表达基因40个,下调差异表达基因32个。对CO与CAPAP组差异表达基因进行GO富集分析,上调基因主要富集于47个条目中,下调基因主要富集于16个条目中,这些基因涉及生物进程和分子功能等多种生物活性方面,说明对乙酰氨基酚对斑马鱼的发育有一定的影响。

关 键 词:对乙酰氨基酚 斑马鱼 荧光定量PCR 转录组

分 类 号:S917.4[水产类] S859.8

参考文献:

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二级参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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