文献类型：期刊文章

作　　者：陈治[1] 陈建威[2] 王晓艳[3] 高天翔[4] 刘岩[5]

CHEN Zhi;CHEN Jian-Wei;WANG Xiao-Yan;GAO Tian-Xiang;LIU Yan(College of Fisheries and Life Science,Hainan Tropical Ocean University,Sanya 572022,China;BGI-Qingdao,BGI-Shenzhen,Qingdao 266555,China;National Engineering Research Center of Marine Facilities Aquaculture,Zhejiang Ocean University,Zhoushan 316022,China;Fisheries College,Zhejiang Ocean University,Zhoushan 316022,China;South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510300,China)

机构地区：[1]海南热带海洋学院水产与生命学院,三亚572022 [2]青岛华大基因研究院,青岛266555 [3]浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,舟山316022 [4]浙江海洋大学水产学院,舟山316022 [5]中国水产科学研究院南海水产研究所,广州510300

出　　处：《海洋与湖沼》

基　　金：国家自然科学基金项目,41776171号,41806180号;国家自然科学基金委2018年度东海春季共享航次,NORC2018-02号

年　　份：2019

卷　　号：50

期　　号：5

起止页码：1098-1107

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：近年来,环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术开始被广泛应用于水生生物多样性研究。本文通过绝对定量和高通量测序技术对舟山近海高浊度水样eDNA的保存方法进行了建立和优化。研究结果如下:(1)“酒精+低温”保存法的eDNA获得量是“酒精+常温”保存法的0.78 1.06(7d)、0.89 1.80(15d)、1.05 2.75(30d)和2.69(60d)倍;(2)酒精保存法(低温、常温)存在eDNA富集物渗漏及滤膜黏附现象;(3)短期内冷冻保存样品的eDNA获得量是酒精保存样品获得量的1.25 1.59倍(7d)和1.07 1.20倍(15d);(4)酒精保存法的eDNA降解速率慢于冷冻保存法,长期内酒精保存样品的eDNA获得量是冷冻保存样品获得量的1.99 2.10倍(30d)和2.84 7.64倍(60d);(5)二次富集(过滤)能显著提高eDNA获得量,富集组eDNA浓度是未富集组浓度的1.60 4.95倍(“酒精+低温”)和1.21 2.04倍(“酒精+常温”);(6)“酒精+低温”保存的样品在高通量测序总丰度、各鱼种分丰度、物种多样性指数等多个方面优于冷冻保存样品;(7)微生物(micro-organism)的eDNA降解速率慢于大生物(macro-organism),不同界(Kingdom)的eDNA最优保存方法可能并不相同。本研究首次建立了舟山近海高浊度水样eDNA最适保存方法,为相似水域的eDNA保存提供了借鉴参考。

关 键 词：舟山近海  eDNA保存  “酒精+低温”  二次过滤  

分 类 号：S931.4]