文献类型：期刊文章

作　　者：王文静[1,2] 王晓霏[3] 刘利英[3] 童东东[2] 李茜[2] 倪磊[2] 郭波[2]

WANG Wen-jing;WANG Xiao-fei;LIU Li-ying;TONG Dong-dong;LI Qian;NI Lei;GUO Bo(Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University Health Science Center, Xi'an 710061;Department of Cell Biology and Genetics, Xi'an Jiaotong University Health Science Center, Xi'an 710061;Key Laboratory and Genes Related to Disease, Ministry of Education/Xi'an Jiaotong University Health Science Center, Xi'an 710061, China)

机构地区：[1]西安交通大学第一附属医院肝胆外科,陕西西安710061 [2]西安交通大学医学部细胞生物学与遗传学系,陕西西安710061 [3]西安交通大学医学部环境与疾病相关基因教育部重点实验室,陕西西安710061

出　　处：《西安交通大学学报（医学版）》

基　　金：陕西省卫生厅科研项目(No.2014D75);陕西省博士后科研项目(No.2016BSHEDZZ90);西安交通大学新教师科研支持计划项目~~

年　　份：2019

卷　　号：40

期　　号：5

起止页码：706-710

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的探讨不同种类肿瘤中miR-338-3p表达谱及其表达异常的表观遗传修饰调控机制。方法生物信息学大数据库(TCGA Pan-Cancer)分析miR-338-3p在15种不同种类肿瘤组织中的表达谱;以胃癌为研究对象,分析数据库中45例正常胃组织和366例胃癌组织中miR-338-3p表达情况;CRCH37数据库预测miR-338-3p上游启动子区组蛋白修饰位点;利用染色质免疫共沉淀获取组蛋白结合的DNA,PCR扩增miR-338-3p启动子区片段,凝胶电泳验证PCR产物。结果 miR-338-3p在包括食道癌(ESCA)等不同种类肿瘤中表达异常,其中ESCA、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、肾嫌色细胞癌(KICH)、肾乳头状肾细胞癌(KIRP)、肺鳞癌(LUSC)和甲状腺癌(THCA)中表达显著下调(P<0.05),而在结肠腺癌(COAD)、肾透明细胞癌(KIRC)和肝细胞肝癌(LIHC)表达显著上调(P<0.05);366例胃癌组织中miR-338-3p表达普遍下调;染色质免疫共沉淀结合PCR证实组蛋白H3K9m2和H3K4m3是可能引起miR-338-3p下调的两个修饰位点。结论 miR-338-3p在胃癌中表达下调,组蛋白H3K9和H3K4甲基化修饰是潜在原因。

关 键 词：miR-338-3p  TCGA数据库  染色质免疫共沉淀  组蛋白修饰 表观遗传

分 类 号：R34[基础医学类]