期刊文章详细信息
利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选
Genetic diversity analysis of 23 cucumber germplasms and screening of core germplasm resources using InDel markers
文献类型:期刊文章
ZHANG Hong-mei;ZHAI Wen;JIN Hai-jun;DING Xiao-tao;YU Ji-zhu(Horticultural Research Institute,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai Key Laboratory of Protected Horticultural Technology,Shanghai 201403,China;College of Chemistry Biology and Material,East China University of Technology,Nanchang 330013,China)
机构地区:[1]上海市农业科学院设施园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403 [2]东华理工大学化学生物与材料科学学院,南昌330013
基 金:上海市科委项目(16391901100);上海市农委种业发展项目[沪农科种字(2017)第3-1-2号)];上海农科院卓越团队项目(农科创B-26)
年 份:2019
卷 号:35
期 号:4
起止页码:28-33
语 种:中文
收录情况:CAB、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:为了研究不同来源黄瓜的亲缘关系,筛选适宜作杂交亲本的种质资源,基于黄瓜重测序开发的InDel标记,应用UPGMA进化树聚类、主成分分析和群体遗传结构分析3种方法分析了23份黄瓜种质的遗传多样性.结果表明:23份黄瓜种质的遗传相似性系数为0.23-0.95,平均值为0.56,相似性系数低于0.6的有137对组合,占全部组合的54%,说明这些材料的遗传多样性较好.3种分析方法均将23份黄瓜种质分为三大类群:P1来源于亚洲,都属于华南类型黄瓜;P2来源于欧洲和美国,包含欧洲类型长黄瓜、欧洲类型短黄瓜和2个美国加工型黄瓜;P3仅包含1个来源于广东的品种,从表型上看属于华南类型.P3亲缘关系更接近P1,P1和P2之间遗传差异明显.利用InDel标记分析的结果,对核心种质最佳样本量进行了预测,应用M策略将9份黄瓜种质确定为核心种质,包含了群体中几乎所有的黄瓜类型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,这9份核心种质能够很大范围地覆盖表型的变异.
关 键 词:黄瓜 INDEL标记 核心种质 遗传多样性
分 类 号:S642.2]
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