期刊文章详细信息
宏基因二代测序技术对厌氧菌感染精准化诊断的临床价值
Clinical value of metagenomic next-generation sequencing in precise diagnosis of anaerobic bacteria infection
文献类型:期刊文章
LI Bing;MIAO Qing;JIN Wen-ting;HUANG Ying-nan;PAN Jue;HU Bi-jie(Zhongshan Hospital of Fudan University , Shanghai 200032, China)
机构地区:[1]复旦大学附属中山医院感染病科
年 份:2019
卷 号:29
期 号:13
起止页码:1927-1930
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的探讨宏基因二代测序技术对厌氧菌感染精准化诊断的临床价值。方法回顾性分析2017年2月-2019年2月复旦大学附属中山医院感染病科收治的16例临床诊断为厌氧菌感染患者的资料。描述其临床特点、比较宏基因二代测序与培养检测外周血、组织匀浆、脓液、灌洗液及无菌体液等标本厌氧菌的阳性率与时间,以阐明宏基因二代基因技术在厌氧菌诊断方面的优势。结果符合入组条件的厌氧菌感染患者共16例。厌氧菌感染部位包括:肺部(8例)、皮肤软组织(2例)、腹腔(1例)、混合部位感染(5例)。同时送厌氧菌培养及宏基因二代测序的微生物标本共29份,标本类型包括:外周血(3份)、组织匀浆(5份)、脓液(11份)、灌洗液(8份)和无菌部位体液(2份)。培养阳性率为20.67%(6/29),宏基因二代测序的阳性率为82.76%(24/29),后者高于前者(P<0.01)。按感染部位分层,肺部感染的标本中宏基因二代测序病原体检出的阳性率为71.43%(10/14)高于培养阳性率7.14%(1/14)(P<0.01);按标本类型分层,发现两种方法检测组织匀浆、脓液和灌洗液时宏基因二代测序的阳性率分别为80.00%(4/5)、100.00%(11/11)和62.50%(5/8),均高于培养阳性率(P<0.05)。二代测序的平均检测时间为(39.66±15.09)h短与培养(81.21±37.94)h(P<0.01)。结论宏基因二代测序技术对厌氧菌感染的病原体评估较培养更敏感、更快捷,在厌氧菌感染的精准化诊断方面具有优势。
关 键 词:宏基因二代测序 培养 厌氧菌感染 诊断
分 类 号:R446.5]
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