文献类型：期刊文章

作　　者：王光兴[1] 石毅[1] 王小晟[2] 张跃[3] 韩泽广[1] 何昆燕[1]

Wang Guangxing;Shi Yi;Wang Xiaosheng;Zhang Yue;Han Zeguang;He Kunyan(Key Laboratory of System Biomedical Education,Shanghai Center for Systems Biomedicine,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai,200240;Department of Basic Medicine,School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy,China Pharmaceutical University,Nanjing,211198;Department ofRheumatology and Immunology,First Clinical College of Harbin Medical University,Haerbin,150001)

机构地区：[1]上海交通大学,系统生物医学研究院,系统生物医学教育部重点实验室,上海200240 [2]中国药科大学基础医学与临床药学学院基础医学系,南京211198 [3]哈尔滨医科大学第一临床医学院风湿免疫科,哈尔滨150001

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金(No.81472621)和(No.81402950)共同资助

年　　份：2019

卷　　号：38

期　　号：7

起止页码：3297-3304

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：ARID1A编码的BAF250a蛋白是SWI/SNF(SWItch/Sucrose Non-Fermentable)染色质重组复合物BAF(BRG1-associated factors)的亚基之一,参与改变染色体的结构和可接近性。ARID1A在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的突变率高达13%,但目前尚无有效的治疗药物。本研究旨在利用合成致死策略寻找携带ARID1A突变HCC的治疗新靶标。首先,本研究通过分析ARID1A突变与肿瘤恶性程度的相关性发现ARID1A突变的肿瘤恶性度增加;进而分析Achilles和NCI-60癌症细胞系中ARID1A突变和野生型细胞系的基因表型值(gene phenotype value,GPV)和高表达基因,获得ARID1A突变细胞低GPV和高表达的重叠基因,再扩大样本使用CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)细胞系的高表达基因进行重叠基因分析;最后并在TCGA(the Cancer Genome Atlas)肝癌数据库中进行筛选,获得116个潜在的ARID1A合成致死基因。本研究运用生物信息学方法计算获得多个ARID1A的潜在合成性致死基因,为ARID1A突变HCC患者提供新的治疗靶点,也为靶向药物研发提供了新靶标和新策略。

关 键 词：ARID1A  合成致死  HCC

分 类 号：R735.7]