期刊文章详细信息
基于转录组测序技术筛选花■卵巢发育相关基因
Transcriptome analysis of spotted steed(Hemibarbus maculatus Bleeker) to identify genes related to ovary development
文献类型:期刊文章
LIU Huifen;LU Liangsheng;WANG Jing;ZHOU Chuanjiang;GU Qianhong;MA Xiao;FENG Junchang;NIE Guoxing;LI Xuejun(Engineering Technology Research Center of Henan Province for Aquatic Animal Cultivation,College of Fisheries,Henan Normal University,Xinxiang 453007,China)
机构地区:[1]河南师范大学水产学院河南省水产动物养殖工程技术研究中心
基 金:河南省创新型科技团队支持计划(CXTD2016043);河南省科技攻关重点项目(162102110147;182102110383);农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室开放课题;河南师范大学博士科研启动课题(qd15186),河南师范大学校青年基金~~
年 份:2019
卷 号:43
期 号:8
起止页码:1714-1722
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为筛选影响花[鱼骨]卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花[鱼骨]脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示,3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads,组装后共获得了99 878个unigenes,平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 305个,脑vs.肝脏组中特异性表达的基因数为839个,卵巢vs.肝脏组中特异性表达的基因数为1 474个,3个比较组共有的差异表达基因数为860个。GO分析发现,上述差异表达基因主要集中在初级代谢过程(primary metabolic process)、单细胞过程(single-organism process)、有机物代谢过程(organic substance metabolic process)等生物学过程中。KEGG pathway分析显示,一些与卵巢发育和减数分裂相关的信号通路得到了显著富集,如GnRH信号通路、类固醇激素合成、TGF-β信号通路、卵母细胞减数分裂等代谢通路。本研究结果丰富了花[鱼骨]的基因资源,可为花[鱼骨]的繁殖生物学研究提供基础数据。
关 键 词:花[鱼骨] 卵巢发育 转录组
分 类 号:Q785S917.4]
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