文献类型：期刊文章

作　　者：赵贵军[1] 竭航[1] 朱吉彬[1] 郑程莉[2] 曾德军[1] 张承露[1] 戚文华[3] 封孝兰[1]

ZHAO Gui-jun;JIE Hang;ZHU Ji-bin;ZHENG Cheng-li;ZENG De-jun;ZHANG Cheng-lu;QI Wen-hua;FENG Xiao-Ian(Chongqing Institute of Medicinal Plant Cultivation, Chongqing Nanchuan 408435, China;Sichuan Institute of Musk Deer Breeding, Sichuan Chengdu 610016, China;Chongqing Three Gorges University, Chongqing Wanzhou 404000, China)

机构地区：[1]重庆市药物种植研究所,重庆南川408435 [2]四川养麝研究所,四川成都610016 [3]重庆三峡学院,重庆万州404000

出　　处：《西南农业学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(31702032);重庆市社会民生项目(cstc2018jscx-msybx0303);重庆市基本科研业务项目(cstc2018jxjl-jbky0025);重庆市卫计委项目(ZY201703081,ZY201802034);中央引导地方项目;重庆市自然科学基金项目(cstc2018jcyjAX0238)

年　　份：2019

卷　　号：32

期　　号：7

起止页码：1652-1658

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】采用16S rRNA高通量测序技术来揭露雄性和雌性林麝的粪便菌群的结构和组成。【方法】选取10只雌性和10只雄性林麝作为试验动物,采集其新鲜粪便,提取微生物总DNA,用细菌通用引物PCR扩增16S rRNA的V3~V4区,用Illumina MiSeq测序平台对扩增产物进行高通量测序,用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。【结果】雄性样本、雌性样本分别平均为57 504±8187条、50 190±6963条有效序列。在α多样性分析中雌雄微生物丰富度和多样性在组间均无显著差异(P>0.05),但雄性微生物的丰富度、多样性高于雌性。门水平中,Firmicutes,Proteobacteria和Bacteroidetes为雌雄主要3个优势门类,其中Bacteroidetes在雌性所占比例较雄性高。科水平中Ruminococcaceae,Lachnospiraceae和*Clostridiales为雌雄主要3个优势科类,此外雌性含有更多的*Bacteroidales,雄性含有更多的Pseudomonadaceae和Enterobacteriaceae。主成分分析和以偏最小二乘回归的判别模型和菌群代谢功能聚类分析都反映出雌性和雄性存在差异,而且发现雄性的样本重复性好于雌性的重复性,但都存在一定的个体差异。【结论】雄性和雌性林麝粪便中细菌组成成分没有显著差异,但同类细菌在不同个体和分组上存在比例上的高低差异,雄性微生物组成包含更多的潜在致病菌例如Pseudomonadaceae,而雌性微生物包含更多有益菌*Bacteroidales,这可能反映出雄性和雌性对于疾病抵抗能力的不同。

关 键 词：林麝 不同性别 粪便微生物 高通量测序  致病菌

分 类 号：S811.6]