文献类型：期刊文章

作　　者：陈立杰[1] 张素勤[2] 尹杰[3] 宋勤飞[3] 牛素贞[3] 赵基英[4] 陈丹萍[4] 王胜威[4] 耿广东[2]

CHEN Li-jie;ZHANG Su-qin;YIN Jie;SONG Qin-fei;NIU Su-zhen;ZHAO Ji-ying;CHEN Dan-ping;WANG Sheng-wei;GENG Guang-dong(Asset Management Office, Guizhou University, Guiyang 550025, China;College of Agriculture, Guizhou University, Guiyang 550025, China;College of Tea Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China;Huaxi District Agricultural Bureau, Guiyang 550025, China)

机构地区：[1]贵州大学资产经营办公室,贵阳550025 [2]贵州大学农学院,贵阳550025 [3]贵州大学茶学院,贵阳550025 [4]贵阳市花溪区农业局,贵阳550025

出　　处：《西南大学学报（自然科学版）》

基　　金：中央财政农业生产发展基金(黔财农[2015]240号);贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2016]2603号,黔科合支撑[2018]2330号)

年　　份：2019

卷　　号：41

期　　号：8

起止页码：33-40

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：试验采用SNP(单核苷酸多态性)技术对贵阳花溪古茶树资源的遗传多样性、群体结构和遗传进化进行了分析.结果表明,利用生物信息学分析古茶树样品的重测序数据,获得了1656258个SLAF标签,古茶树样品平均测序深度为24.21x,其中多态性的SLAF标签有462897个,共得到283376个高一致性的群体SNP标记.从基于SNP标记获得的进化树可以看出,来自相近地方的古茶树在进化树上基本上处于相近位置,但是花溪古茶树存在着广泛的遗传变异,主成分分析(PCA)获得了与进化树一致的结果.群体结构分析可清晰地把古茶树资源分为乔木型和灌木型2个类群.乔木型古茶树位于进化树下部,而灌木型古茶树处于进化树上部,表明茶树是由乔木型向灌木型进化的.

关 键 词：古茶树 特异位点扩增片段测序(SLAF-seq)  SNP  进化树 PCA  遗传结构  

分 类 号：S571.1]