文献类型：期刊文章

作　　者：吴欢欢[1,2] 王伟继[2] 吕丁[2] 胡玉龙[2] 孔杰[1,2]

WU Huanhuan;WANG Weiji;LU Ding;HU Yulong;KONG Jie(Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Ministry of Education,College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306;Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao 266071)

机构地区：[1]上海海洋大学水产与生命学院水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306 [2]中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业资源可持续利用重点实验室,青岛266071

出　　处：《渔业科学进展》

基　　金：山东省农业良种工程项目“泰山学者种业计划专家项目”(ZR2014CQ001);山东省农业良种工程项目“大菱鲆种质资源精准鉴定与选种育种创新利用-子课题”(2016LZGC031-2)共同资助~~

年　　份：2019

卷　　号：40

期　　号：4

起止页码：84-94

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、DOAJ、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：采用基于Illumina测序平台的高通量测序技术,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼鱼肠道及其养殖水体、生物饵料中细菌种类及丰度进行研究。测序结果显示,养殖水体、生物饵料和大菱鲆幼鱼肠道等19个样品共获得有效序列547621条,可聚类于3771个可分类操作单元(OTUs),归属于养殖水体、生物饵料、健康幼鱼和发病幼鱼的操作分类单元(OTU)个数分别为3038、1090、87和777,其中,健康幼鱼与生物饵料、健康幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为57和0,发病幼鱼与生物饵料、发病幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为481和31。表明幼鱼肠道微生物多样性与生物饵料密切相关。根据细菌注释结果,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)在大菱鲆幼鱼肠道中占优势地位,其中,健康幼鱼肠道微生物共聚类为8个门,发病幼鱼的肠道微生物可聚类为19个门。与健康幼鱼相比,发病幼鱼肠道门水平上的3种主要优势菌群落结构出现失衡。此外,对各样品中丰度最高的100位OTU分析显示,幼鱼肠道优势菌种类与生物饵料中的优势菌种类密切相关,而每个发病幼鱼肠道优势菌种类具有一定的独立性。本研究旨在为大菱鲆健康养殖和微生态调控提供实验依据。

关 键 词：生物多样性 高通量测序 大菱鲆

分 类 号：S968]