文献类型：期刊文章

作　　者：张蕊[1] 吴启洋[1] 刘纪明[1] 郭晓仪[1] 吴龙火[1]

ZHANG Rui;WU Qi-yang;LIU Ji-ming;GUO Xiao-yi;WU Long-huo(Gannan Medical University Pharmaceutical Engineering Department, College of Pharmacy, Ganzhou, Jiangxi 341000;Gannan Medical University, Ganzhou, Jiangxi 341000)

机构地区：[1]赣南医学院药学院制药工程教研室

出　　处：《赣南医学院学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(81660371);江西省教育厅科技青年项目(GJJ170886)

年　　份：2019

卷　　号：39

期　　号：5

起止页码：433-439

语　　种：中文

收录情况：普通刊

摘　　要：目的:通过生物信息学软件分析和预测在人骨肉瘤中能够靶向结合Gab2的miRNA。方法:首先通过生物信息学软件mir Walk 2. 0预测可以靶向结合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的热力学稳定性评分和序列保守性评分。并通过人骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差异表达的miRNA。在生物信息学软件打分较高的miRNA中选出差异表达的miRNA,从而选出人骨肉瘤中能与Gab2结合的特异性最强,稳定性最高的miRNA。结果:mir Walk 2. 0预测有22个miRNA可与Gab2靶向结合;其中,miR-1236-3p、miR-218-5p与Gab2结合的稳定性和特异性最好;在人骨肉瘤中差异表达的miRNA有184个,而miR-218-5p的表达也存在差异性,并且表达下调。结论:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向结合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因。

关 键 词：人骨肉瘤 生物信息学 Gab2  MIRNAS 靶基因

分 类 号：R730.2]