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大豆PHD家族蛋白的全基因组鉴定及表达特征分析
Genome-Wide Identification and Expression Patterns Analysis of the PHD Family Protein in Glycine max
文献类型:期刊文章
Yang Junkai;Shen Yang;Cai Xiaoxi;Wu Shengyang;Li Jianwei;Sun Mingzhe;Jia Bowei;Sun Xiaoli(College of Agronomy, Heilongjiang Bayi Agricultural University/Crop Stress Molecular Biology Laboratory, Daqing 163319, Heilongjiang, China)
机构地区:[1]黑龙江八一农垦大学农学院/作物逆境分子生物学实验室
基 金:国家自然科学基金面上项目(31671596);中国博士后科学基金特别资助项目(2017T100253);黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目(YJSCX2017-Y08)
年 份:2019
期 号:3
起止页码:55-65
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:PHD(Plant Homeodomain Finger)基因家族编码一类锌指转录因子,广泛参与植物的生长发育和逆境应答过程。通过全基因组鉴定获得了95个大豆PHD家族蛋白。通过共线性分析、进化树构建、基因结构和功能结构域鉴定、GO注释分析、不同组织间和非生物胁迫下表达分析等,获得了大豆PHD家族基因复制、家族进化、保守结构域及基因表达等信息。结果表明,大豆PHD基因在家族进化、基因结构和保守结构域上存在较大变异,可能参与Zn2+结合、DNA结合及表观遗传调控等分子过程,参与调控植物生长发育和逆境应答。这些结果为进一步研究大豆PHD家族在生长发育和逆境应答中的生物学功能提供重要线索。
关 键 词:大豆 PHD转录因子 PHD家族分析 表达特征 逆境胁迫
分 类 号:S565.1]
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