文献类型：期刊文章

作　　者：伍娜娜[1,2] 荣娜[1,2] 康超[1,2] 刘祥[1,2] 陈琛[1,2] 陈春琳[1,2] 丁锐[1,2] 吴三桥[1,2]

WU Nana;RONG Na;KANG Chao;LIU Xiang;CHEN Chen;CHEN Chunlin;DING Rui;WU Sanqiao(Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research,College of Biological Sciences and Engineering,Shaanxi University of Technology,Hanzhong 723001,China;Shaanxi Engineering Research Center for Tall Gastrodia Tuber and Medical Dogwood,Hanzhong 723001,China)

机构地区：[1]陕西理工大学生物科学与工程学院/中德天然产物研究所,陕西汉中723001 [2]陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心,陕西汉中723001

出　　处：《河南农业科学》

基　　金：陕西理工大学人才项目(SLGQD1803);陕西省教育厅科学研究计划项目(17JK0137);国家外国专家局项目(GDT20186100426)

年　　份：2019

卷　　号：48

期　　号：6

起止页码：131-138

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为进一步提高大肠杆菌外膜蛋白(OmpA)的免疫效果,对大肠杆菌的OmpA进行生物信息学分析并设计其表位多肽重组疫苗。运用DNAMAN 8.0和MEGA 5.0分别对OmpA进行同源性及系统发生分析,通过ExPASy-ProtParam对OmpA的理化性质进行分析,分别采用Signal P 4.1与TMHMM Serverv.2.0对OmpA进行信号肽和跨膜结构预测,应用SOPMA和SWISS-MODEL对OmpA进行二级结构和三级结构预测,通过String进行蛋白质互作网络分析,使用BepiPred 1.0和ABCpred方法预测OmpA的B细胞抗原表位,利用神经网络法与MHC-Ⅱ类分子结合肽在线预测程序预测OmpA的CTL和Th细胞抗原表位,采用DNASTAR.Lasergene.v 7.1拼接获得优势抗原表位。进化关系结果显示,OmpA在肠道菌属间遗传进化关系较近,OmpA抗体可能为不同种肠道细菌的感染提供交叉免疫保护。OmpA为亲水性蛋白质,第1—21位氨基酸为信号肽位置,具跨膜结构。OmpA的二级结构中以无规则卷曲(45.66%)、α-螺旋(31.79%)、β-片层(16.18%)和β-转角(6.36%)为主,其三级结构为桶状结构。OmpA与par、coa蛋白之间存在互作。OmpA可能有4个B细胞抗原表位,1个CTL细胞抗原表位,1个Th细胞抗原表位,且重组获得抗原性较好的OmpA表位多肽。

关 键 词：大肠杆菌 OMPA 表位多肽疫苗  生物信息学分析

分 类 号：S182] Q816[生物工程类]