文献类型：期刊文章

作　　者：王芳平[1] 王志坚[1] 李永香[2]

Wang Fangping;Wang Zhijian;Li Yongxiang(Department of physics, School of Electronic Information and Electrical Engineering, Tianshui Normal University, Tianshui, 741001;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot, 010021)

机构地区：[1]天水师范学院电子信息与电气工程学院物理系,天水741001 [2]内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特010021

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金(11665019);甘肃省科技计划(18JR3RE241)共同资助

年　　份：2019

卷　　号：38

期　　号：5

起止页码：2215-2220

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：GC含量是核酸序列组成的重要特征,其含量可作为反映进化的一种指标。为了探索GC含量作用于基因组的进化压力,本研究研究了大肠杆菌(Escherichia coli)和枯草杆菌(Bacillus subtilis)、真核生物酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)三种模式微生物基因组编码序列的GC含量,分析了其基因组中蛋白质编码序列的GC含量与编码序列长度的关联,结果发现编码序列的GC含量与序列相对频数有一定的相关性,且编码序列的GC含量随序列相对频数的分布具有一定的规律。根据分布曲线我们推测这种规律应该符合某种分布,并用各种分布函数进行拟合,研究结果发现基因组中编码序列的GC含量随序列频数的分布与高斯分布相符合,且这种分布在真核生物和原核生物间有显著区别。另外,不同长度的编码序列GC含量的分析结果表明,编码序列的GC含量与序列长度有一定的相关性。

关 键 词：大肠杆菌(Escherichia  coli)  枯草杆菌(Bacillus  subtilis)  真核生物酿酒酵母(Saccharomyces  cerevisiae)GC含量  高斯分布  

分 类 号：Q933]