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期刊文章详细信息

葡萄霜霉病菌实时荧光定量PCR检测体系的建立和应用    

Establishment and Application of Real-Time PCR for Quantitatively Detecting Plasmopara viticola in Vitis vinifera

  

文献类型:期刊文章

作  者:李文学[1] 肖瑞刚[2] 吕苗苗[1] 丁宁[1] 石华荣[2] 顾沛雯[1]

LI WenXue;XIAO RuiGang;LU MiaoMiao;DING Ning;SHI HuaRong;GU PeiWen(School of Agriculture, Ningxia University, Yinchuan 750021;Wine School, Ningxia University, Yinchuan 750021)

机构地区:[1]宁夏大学农学院,银川750021 [2]宁夏大学葡萄酒学院,银川750021

出  处:《中国农业科学》

基  金:国家科技改革与发展专项(106001000000150012);宁夏回族自治区"十三五"重大科技项目(2016BZ06)

年  份:2019

卷  号:52

期  号:9

起止页码:1529-1540

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:【目的】葡萄霜霉病是葡萄生产上重要的单年流行病害,研究旨在构建葡萄霜霉病菌(Plasmopara viticola)的实时荧光定量PCR(real-time PCR)检测体系,为葡萄霜霉病的早期诊断和预测预报提供依据。【方法】依据GenBank中葡萄霜霉病菌cox2基因序列设计1对特异性引物(F-cox-Pv/R-Pv),建立并优化常规PCR和real-time PCR反应体系,利用葡萄霜霉病菌、葡萄炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)、葡萄白粉病菌(Uncinula necator)、葡萄灰霉病菌(Botrytis cinerea)、葡萄白腐病菌(Coniella diplodiella)、葡萄溃疡病菌(Botryosphaeria dothidea)、白菜黑斑病菌(Alternaria brassicae)、辣椒炭疽病菌(C.capsica)、甘草根腐病菌(Fusarium solani)、西葫芦白粉病菌(Sphaerotheca fuliginea)、番茄菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)、马铃薯干腐病菌(F.equiseti)、西瓜枯萎病菌(F.oxysporum)、哈茨木霉(Trichoderma harzianum)等14种葡萄及其他作物病原菌和拮抗菌的菌丝DNA进行常规PCR和real-time PCR特异性检测,并对灵敏度和可重复性进行评价。运用已构建的real-time PCR体系对人工接种葡萄霜霉病菌的潜育期叶片内病原菌DNA进行定量检测,利用SPSS 19.0软件分析接种时间与叶片内葡萄霜霉病菌潜伏侵染量的关系。【结果】研究设计的引物特异性高,常规PCR仅对葡萄霜霉病菌DNA有扩增条带,为139 bp;real-time PCR检测结果表明该对引物对葡萄霜霉病菌有唯一的产物吸收峰,对其他供试菌株均未检测到产物吸收峰。常规PCR检测的灵敏度为10 pg·μL^(-1),real-time PCR的灵敏度可达到0.1 pg·μL^(-1),是常规PCR检测灵敏度的100倍。以携带目的基因片段的重组质粒为标准品,构建real-time PCR循环阈值(Ct)与模板浓度的线性关系,标准曲线y=42.27-3.36x,相关系数R^2=0.997,扩增效率为98.50%,线性范围达7个数量级,在2.4×10~3—2.4×10~9 copies/μL呈现良好的线性关系。对人工接种葡萄霜霉病菌的潜�

关 键 词:葡萄霜霉病菌 COX2 实时荧光定量PCR 潜伏侵染 定量检测  

分 类 号:S436.631.1]

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同被引文献:

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