文献类型：期刊文章

作　　者：熊向英[1] 王贤丰[2] 彭银辉[3] 王志成[1]

XIONG Xiangying;WANG Xianfeng;PENG Yinhui;WANG Zhicheng(Guangxi Key Laboratory of Marine Biotechnology,Guangxi Institute of Oceanology,Beihai 536000,China;National Sea Area Dynamic Supervising Center of Haicheng Beihai,Beihai 536000,China;Guangxi Key Laboratory of Beibu Gulf Marine Biodiversity Conservation,College of Marine Sciences-Beibu Gulf University,Qinzhou 535011,China)

机构地区：[1]广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室,广西北海536000 [2]北海市海城区国家海域动态监管中心,广西北海536000 [3]北部湾大学海洋学院广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室,广西钦州535011

出　　处：《水产学报》

基　　金：广西自然科学基金(2015GXNSFAA139088);广西科学院基本科研业务费专项(15YJ22HYS14);广西科技计划项目(AB16380167;AB18221112);广西创新驱动发展专项(AA17204044);北海市科技计划项目(201884028);广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室自主项目(2019ZB07)~~

年　　份：2019

卷　　号：43

期　　号：5

起止页码：1317-1325

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为研究病害发生后卵形鲳鲹肠道菌群结构的差异及其与养殖环境的关系,分析不同样品中的菌群组成和细菌多样性。实验采用Illumina HiSeq高通量测序技术和生物信息学分析手段,分别构建了健康鱼水样、患病鱼水样、健康鱼肠道、患病鱼肠道和饵料颗粒5个样品中菌群的16S rRNA基因测序文库。研究表明,与健康鱼肠道细菌组成相比,患病鱼肠道中螺旋体门相对丰度显著升高,厚壁菌门和拟杆菌门相对丰度显著降低;患病后肠道中的细菌种类仅为健康鱼肠道细菌种类总数的54.94%;健康卵形鲳鲹肠道菌群中有73.46%的可操作分类单元(OTUs)与水体样品中OTUs一致,有70.58%与饲料样品一致,而患病后分别只有17.98%和38.95%的OTUs与水体和饲料样品一致。健康卵形鲳鲹肠道中黑海弧菌的相对丰度为17.19%,患病后该菌的相对丰度大幅提高,达到78.90%;健康鱼肠道中鳆发光杆菌占比54.53%,患病鱼肠道中不含鳆发光杆菌。健康和患病鱼肠道菌群种类组成类似,但存在一定差异,病害的发生会导致肠道细菌多样性显著降低。健康鱼肠道菌群与养殖环境和颗粒饲料中菌群组成关系密切,而患病后鱼肠道细菌多样性受环境中菌群的影响较小。黑海弧菌在患病鱼肠道中的大量增殖可能是引起其患病的重要原因。

关 键 词：卵形鲳鲹 肠道 养殖水体 菌群 高通量测序

分 类 号：S945.4] Q786[水产类]