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REPLI-g~? Single Cell Kit应用于微量DNA扩增的效率评估
Evaluating the Efficiency of REPLI-g~? Single Cell Kit for Trace DNA Amplification
文献类型:期刊文章
XU Qian-nan;SHEN Qiong;ZHANG Jia-yi;ZHANG Yi-lun;LI Li;LIU Xi-ling;LI Cheng-tao(Department of Forensic Medicine,School of Basic Medical Sciences,Wenzhou Medical University,Wenzhou 325035,Zhejiang Province,China;Shanghai Key Laboratory of Forensic Medicine,Shanghai Forensic Service Platform,Academy of Forensic Science,Shanghai 200063,China;Department of Ultrasound Diagnosis,Shanghai Ninth People’s Hospital,School of Medicine,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 201999,China;Department of Forensic Medicine,Inner Mongolia Medical University,Hohhot 010030,China;Baotou Medical College,Inner Mongolia University of Science & Technology,Baotou 014060,Inner Mongolia Autonomous Region,China)
机构地区:[1]温州医科大学基础医学院法医学系,浙江温州325035 [2]司法鉴定科学研究院上海市法医学重点实验室上海市司法鉴定专业技术服务平台,上海200063 [3]上海交通大学医学院附属第九人民医院超声诊断科,上海201999 [4]内蒙古医科大学法医学教研室,内蒙古呼和浩特010030 [5]内蒙古科技大学包头医学院,内蒙古包头014060
基 金:"十三五"国家重点研发计划资助项目(2018YFC0807202);国家自然科学基金资助项目(81871534;81625013);中央级科研院所公益专项资助项目(GY2017G-3);上海市标准研制资助项目(17DZ2203800);上海市科技创新行动计划资助项目(16DZ1205500);上海市法医学重点实验室资助项目(17DZ2273200);上海市司法鉴定专业技术服务平台资助项目(19DZ2292700);上海市人才项目(2017485;2017115;2018111)
年 份:2019
卷 号:35
期 号:2
起止页码:210-215
语 种:中文
收录情况:CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的评估REPLI-g~?Single Cell Kit应用于检材DNA扩增的效率,探讨该试剂盒在法医学微量DNA扩增方面的应用价值。方法选取3种微量DNA提取试剂盒,对来自10名无关个体的外周血进行DNA提取,并对所提DNA的产量和纯度进行比较。根据比较结果选取1例DNA样本进行浓缩稀释作为全基因组扩增起始样本,使用REPLI-g~?Single Cell Kit对起始样本进行全基因组扩增,计算扩增产量及扩增倍数,并进行琼脂糖凝胶电泳检测片段分布情况。使用Goldeneye~? DNA身份鉴定系统20A对起始样本和经全基因组扩增所得DNA进行STR分型。结果经比较后选取由QIAsymphony~? DNA Investigator~? Kit所提取的1例DNA进行浓缩稀释作为全基因组扩增起始样本。经REPLI-g~?Single Cell Kit对一系列起始样本全基因组扩增后,发现扩增产量均值最低可达到8.77×10~3ng,相应的扩增倍数均值为1.40×10~6,DNA片段大且集中。全基因组扩增样本随着起始样本量的减少,STR分型成功率降低,但当起始样本量低于0.5ng时,全基因组扩增后样本的STR分型成功率高于相同起始量未经全基因组扩增样本的STR分型成功率。结论应用REPLI-g~?Single Cell Kit可有效提高模板DNA总量,特别对于微量DNA,可在一定程度上提高STR分型成功率。
关 键 词:法医遗传学 短串联重复 全基因组扩增 多重置换扩增 微量检材
分 类 号:DF795.2[法医学类]
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