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期刊文章详细信息

基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究    

Studies on Diversity of Rhizosphere Microorganism in Quinoa Continuous Cropping Soil by High Throughput Sequencing

  

文献类型:期刊文章

作  者:董艳辉[1,2] 于宇凤[1] 温鑫[1] 王亦学[1] 聂园军[3] 侯丽媛[1] 李亚莉[1] 刘江[1] 任元[2,4] 王育川[1] 曹秋芬[1] 吴慎杰[1] 王斌[5] 秦永军[1,2]

DONG Yanhui;YU Yufeng;WEN Xin;WANG Yixue;NIE Yuanjun;HOU Liyuan;LI Yali;LIU Jiang;REN Yuan;WANG Yuchuan;CAO Qiufen;WU Shenjie;WANG Bin;QIN Yongjun(Research Center of Biotechnology,Shanxi Academy of Agricultural Sciences,Taiyuan 030031,China;Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau,Ministry ofAgriculture,Taiyuan 030031,China;Institute of Agricultural Resources and Economy,Shanxi Academyof Agricultural Sciences,Taiyuan 030031,China;Institute of Crop Germplasm Resources,ShanxiAcademy of Agricultural Sciences,Taiyuan 030031,China;Institute of Agriculture Environment andResources,Shanxi Academy of Agricultural Sciences,Taiyuan 030031,China)

机构地区:[1]山西省农业科学院生物技术研究中心,山西太原030031 [2]农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室,山西太原030031 [3]山西省农业科学院农业资源与经济研究所,山西太原030031 [4]山西省农业科学院农作物品种资源研究所,山西太原030031 [5]山西省农业科学院农业环境与资源研究所,山西太原030031

出  处:《华北农学报》

基  金:山西省农科院博士基金项目(YBSJJ1611);山西省农科院特色农业攻关项目(YGG17065);山西省农科院院县共建项目(YCX2018D2T05);山西省农科院科技创新项目(YCX2018P2T01);山西省科技厅政府购买公共服务项目;农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室子课题

年  份:2019

卷  号:34

期  号:2

起止页码:205-211

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序。结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4%,ACE指数平均值增加22.9%,Shannon指数平均值增加2.3%;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少。功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加。

关 键 词:藜麦  连作 高通量测序 根际土壤 生物多样性

分 类 号:S144]

参考文献:

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同被引文献:

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