文献类型：期刊文章

作　　者：连凯琪[1] 周玲玲[1] 张明亮[1] 张慢[1] 王英杰[1] 宋玉伟[1] 关现军[1]

LIAN Kaiqi;ZHOU Lingling;ZHANG Mingliang;ZHANG Man;WANG Yingjie;SONG Yuwei;GUAN Xianjun(School of Biotechnology and Food Engineering, Anyang Institute of Technology/Academician Workstation of Animal Disease Control and Nutrition Immunity in Henan Province/Henan Joint International Research Laboratory of Veterinary Biologies Research and Application, Anyang 455000, China)

机构地区：[1]安阳工学院生物与食品工程学院/河南省动物疫病防控与营养免疫院士工作站/河南省兽用生物制品研发与应用国际联合实验室,河南安阳455000

出　　处：《黑龙江畜牧兽医》

基　　金：安阳工学院博士科研启动基金项目(BSJ2016008)

年　　份：2019

期　　号：5

起止页码：5-9

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、RCCSE、核心刊

摘　　要：为了对疑似新发猪圆环病毒3型(PCV-3)感染病例进行确诊,试验采用PCR技术鉴定1例疑似感染PCV-3的猪,并将鉴定得到的PCV-3毒株的全基因组分成2个片段进行PCR扩增,分别构建到pMD18-T载体上测序,通过MegAlign软件对全基因序列进行同源性和遗传进化分析,利用在线生物信息学软件预测Cap和Rep蛋白的信号肽、核定位信号和B细胞表位。结果表明:成功鉴定出1株豫北新发PCV-3毒株,将此毒株命名为PCV-3/CN/HNAY-201806;对2个基因片段测序后拼接发现其基因组长度为2 000 bp(登录号为MH683051);同源性和遗传进化分析显示,PCV-3/CN/HNAY-201806与吉林长春毒株PCV-3/CHN/JLCC2016(登录号为KY421348.1)核苷酸同源性(99.6%)较高,与广西毒株PCV-3/GXFC2017-7(登录号为MG250186.1)同源性(98.8%)较低,不同地区间PCV-3基因组有差异但较小;对该毒株Cap和Rep蛋白序列分析显示,2个蛋白都没有信号肽序列,但都有核定位信号,Cap蛋白有9个B细胞表位,Rep蛋白有14个B细胞表位。

关 键 词：猪圆环病毒3型  基因组 序列分析  Cap基因  Rep基因  B细胞表位

分 类 号：S852.659.2] Q786[动物医学类]