期刊文章详细信息
基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展
Advances in mammalian three-dimensional genome by usingHi-C technology approach
文献类型:期刊文章
Chunyou Ning;Mengnan He;Qianzi Tang;Qing Zhu;Mingzhou Li;Diyan(Li Institute of Animal Genetics and Breeding,College of Animal Science and Technology,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China)
机构地区:[1]四川农业大学动物科技学院动物遗传育种研究所,成都611130
基 金:国家重点研发计划项目(编号:2018YFD0500403);国家自然科学基金项目(编号:31772576)资助~~
年 份:2019
卷 号:41
期 号:3
起止页码:215-233
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象。高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformationcapture, Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识。研究表明,哺乳动物基因组三维层级结构单元由大到小依次为染色体疆域(chromosome territory, CT)、染色质区室(chromatin compartment A/B)、拓扑关联结构域(topological associated domain, TAD)和染色质环(chromatin loop),这些层级结构单元在基因转录和表达调控过程中发挥着重要作用。本文基于Hi-C技术从染色质的三维层级结构划分、构象单元作用以及三维基因组在发育、疾病等方面的应用进行阐述,旨在为更深入地了解哺乳动物三维基因组学研究提供参考。
关 键 词:三维基因组学 染色质空间构象 Hi-C技术 基因表达调控
分 类 号:Q953]
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