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期刊文章详细信息

团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发    

Isolation of SNP markers associated with hypoxia tolerance in Megalobrama amblycephala

  

文献类型:期刊文章

作  者:陈柏湘[1,2] 王伟峰[1] 王卫民[1] 王焕岭[1]

CHEN Boxiang;WANG Weifeng;WANG Weimin;WANG Huanling(College of Fisheries,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;Foshan Nanhai Bairong Improved Aquatic Seed Co.,Ltd,Guangdong Province,Foshan 528216,China)

机构地区:[1]华中农业大学水产学院,武汉430070 [2]广东佛山市南海百容水产良种有限公司,佛山528216

出  处:《华中农业大学学报》

基  金:国家自然科学基金项目(31872542);中央高校基本业务费专项(2013PY067)

年  份:2019

卷  号:38

期  号:2

起止页码:23-29

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32~35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关,但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体,在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。

关 键 词:团头鲂 低氧 SNP 性状关联分析

分 类 号:S917[水产类] Q959.468]

参考文献:

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同被引文献:

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