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转录因子ZnF-706在鳞翅目昆虫中的进化格局及在家蚕中的功能
Evolutionary pattern of the transcription factor ZnF-706 in Lepidoptera and its function in Bombyx mori
文献类型:期刊文章
CUI Yong;ZHU Ya-Nan;HUANG Yue-Ying;TAN Li-Zhuang;FENG Qi-Li;WANG Wen;XIANG Hui(Guangdong Provincial Key Laboratory of Insect Developmental Biology and Applied Technology,Guangzhou Key Laboratory of Insect Development Regulation and Application Research,Institute of Insect Science and Technology,School of Life Sciences,South China Normal University,Guangzhou 510631,China;State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution,Kunming Institute of Zoology,Chinese Academy of Sciences,Kunming 650223,China;Research Center for Ecology and Environmental Sciences,Northwestern Polytechnical University,Xi′an 710129,China)
机构地区:[1]华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所广东省昆虫发育生物学与应用技术重点实验室&广州市昆虫发育与应用技术重点实验室,广州510631 [2]中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,昆明650223 [3]西北工业大学生态与环境保护研究中心,西安710129
基 金:国家自然科学基金项目(31330071)
年 份:2019
卷 号:62
期 号:1
起止页码:9-20
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:【目的】探讨家蚕Bombyx mori的潜在驯化基因——转录因子ZnF-706在鳞翅目(Lepidoptera)昆虫进化过程及家蚕驯化过程中的分子进化格局;并基于CRISPR/Cas9家蚕基因组编辑平台,探讨ZnF-706基因在家蚕中的功能。【方法】首先分析了家蚕ZnF-706序列特征,并利用已发表芯片数据调研该基因在家蚕幼虫组织中的表达格局;利用Phylogenetic Analysis byMaximum Likelihood (PAML)分支检验方法,分析该基因在鳞翅目不同类群中的分子进化格局。基于已发表的家蚕-野桑蚕Bombyx mandarina群体基因组多态性数据,对ZnF-706进行基因区域人工选择信号分析;对ZnF-706基因上游2 kb的调控区域进行单核苷酸多态性位点频率检测,发掘在家蚕群体中固定下来的突变位点;针对突变位点所在区域进行转录因子结合活性预测。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除ZnF-706基因,获得纯和突变体;以野生型家蚕为对照,检测突变体的茧重及蛹重变化。【结果】家蚕ZnF-706的编码蛋白具有典型的锌指蛋白结构域。ZnF-706在家蚕5龄第3天幼虫各组织中广泛表达,尤其表皮、脂肪体和生殖腺中有很高的表达量;该基因在鳞翅目、蚕蛾总科(Bombycoidea)及天蚕Antherea yamamai 3个分支中均呈现快速进化信号,在家蚕中有强烈的人工选择信号。该基因所在基因组区域的家蚕-野桑蚕种群分歧度参数Fst明显升高,家蚕群体中的群体多样性π明显降低,表明它位于一个选择扫荡区域内;该基因在家蚕-野桑蚕中的9个SNP位点存在于上游调控区,并位于转录因子结合活性区域内。该基因的纯合家蚕突变体ΔZn F-706生存力减弱,并且茧重以及蛹重与野生型家蚕相比都显著降低。但与黑腹果蝇Drosophila melanogaster中不同的是,家蚕中该基因的突变并不致死。【结论】ZnF-706可能在鳞翅目尤其是泌丝昆虫中进化,并在家蚕驯化过程中受到选择压力,提示其对于特征性状�
关 键 词:鳞翅目 家蚕 泌丝昆虫 驯化基因 转录因子 CRISPR/Cas9
分 类 号:Q966]
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