期刊文章详细信息
亚麻芥未成熟胚中磷脂酶基因家族的转录组学分析
Transcriptome analysis of phospholipase gene family in immature embryo of Camelina sativa
文献类型:期刊文章
LI Xiao-wei;JI Shu-han;ZHAO Xu;ZHANG Bai-bing;WANG Fa-wei;LI Hai-yan(College of Life Sciences,Jilin Agricultural University/Engineering Research Center of Bioreactor and Pharmaceutical Development,Ministry of Education,Changchun130118,China;Jilin Anxin Food Technology Services Limited Company,Changchun130033,China)
机构地区:[1]吉林农业大学生命科学学院/生物反应器与药物开发教育部工程研究中心,吉林长春130118 [2]吉林省安信食品技术服务有限责任公司,吉林长春130033
基 金:国家自然科学基金项目(31601323;31201144);吉林省科技厅项目(20170101015JC);国家级大学生创新创业训练计划项目(201610193043)
年 份:2018
卷 号:40
期 号:6
起止页码:793-800
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了解磷脂酶基因家族在亚麻芥胚中的表达情况,本研究基于454测序技术对亚麻芥花后10d(DAF10)和花后20d(DAF20)的胚中磷脂酶基因家族进行筛选和分析。测序结果表明,DAF10样本和DAF20样本分别获得有效序列521 507个和310 125个,序列长度主要分布在341~560 bp,序列组装分别获得25 398个和23 678个Unigene,Unigene平均长度分别为630 bp和654 bp。在此基础上,筛选两个样本全部Unigene,共获得磷脂酶基因36个,其中属于磷脂酶A1基因4个、磷脂酶A2基因9个、磷脂酶C基因10个、磷脂酶D基因13个。Pathway基因功能注释显示,PLA1的4个候选基因没有注释到任何代谢通路上;PLA2中只有候选基因Unigene19110被成功注释,它在植物中主要参与甘油磷脂代谢途径和醚酯代谢途径。PLC家族中只有4个候选成员Unigene443、Unigene8071、Unigene8213和Unigene7311被成功注释,它们除参与甘油磷脂代谢和醚酯代谢之外,还在肌醇磷酸代谢途径中发挥重要作用。而PLD家族中除Unigene18630、Unigene17966和Unigene441没有代谢通路注释信息外,其他的10个成员,也都只在甘油磷脂代谢途径和醚酯代谢途径有作用。
关 键 词:亚麻芥 转录组 磷脂酶 基因 代谢通路
分 类 号:S565.9]
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