文献类型：期刊文章

作　　者：赵奇[1] 邓培渊[2] 李玉华[1] 杨玉珍[1] 杨宗渠[1] 雷志华[1]

ZHAO Qi;DENG Pei-yuan;LIYu-hua;YANG Yu-zhen;YANG Zong-qu;LEI Zhi-hua(School of Life Science,Zhengzhou Normal University,Zhengzhou 450044,China;Key Laboratory of Biological Species Resource Research of Zhengzhou,Zhengzhou Normal University,Zhengzhou 450044,China)

机构地区：[1]郑州师范学院生命科学学院,郑州450044 [2]郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室,郑州450044

出　　处：《南方农业学报》

基　　金：河南省科技攻关项目(182102310655);河南省教育厅高等学校重点科研项目(19A180033);郑州师范学院科技创新团队计划项目(702011)

年　　份：2018

卷　　号：49

期　　号：11

起止页码：2193-2197

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、FSTA、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：【目的】研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14∶Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据。【方法】运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14∶Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用MMPBSA.py模块计算PxylPBP2-Z9-14∶Ac复合物的结合自由能,以Amber12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14∶Ac的结合模式及相互作用力。【结果】同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14∶Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14∶Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43%。【结论】范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14∶Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上。

关 键 词：小菜蛾 性信息素结合蛋白(PxylPBP2)  性信息素 分子动力学模拟 能量分解  

分 类 号：S433.4]