文献类型：期刊文章

作　　者：郭磊[1] 吕静[2] 刘继军[1] 黄云飞[1] 王阳阳[3] 王冀邯[2] 赵和平[2]

GUO Lei;LYU Jing;LIU Jijun;HUANG Yunfei;WANG Yangyang;WANG Jihan;ZHAO Heping(Department of Spinal Surgery,Honghui Hospital,Xi′an Jiaotong University, Xi′an,Shaanxi 710054,China;Department of Clinical Laboratory,Honghui Hospital,Xi′an Jiaotong University,Xi′an,Shaanxi 710054,China;Department of Multimedia,the Tenth Research Institute of Telecommunications Technology,Xi′an,Shaanxi 710000,China)

机构地区：[1]西安交通大学附属红会医院脊柱外科,陕西西安710054 [2]西安交通大学附属红会医院检验科,陕西西安710054 [3]电信科学技术第十研究所多媒体技术部,陕西西安710000

出　　处：《国际检验医学杂志》

基　　金：国家自然科学基金青年科学基金资助项目(81702067);中国博士后科学基金面上资助项目(2017M613176);陕西省自然科学基础研究计划项目(2017JQ8041)

年　　份：2018

卷　　号：39

期　　号：21

起止页码：2604-2609

语　　种：中文

收录情况：CAS、CSA、CSA-PROQEUST、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的探讨肥胖人群内脏脂肪细胞分泌的外泌体中miRNAs表达谱的改变,寻找与肥胖相关的差异表达miRNAs,为肥胖及其相关疾病发病机制的探讨和有效预防提供理论基础。方法运用R/Bioconductor软件平台对美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台中的GEO芯片数据集GSE50574进行差异miRNAs表达谱分析,使用3个主要的生物信息学网站(TargetScan、miRDB和miRWalk)对差异表达miRNAs进行靶基因预测,基于Cytoscape软件构建差异表达miRNAs-target genes调控网络,通过DAVID注释工具对网络中的基因进行功能注释。结果与健康对照相比,肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱显示19个miRNAs表达水平发生显著变化(倍数改变>2,P<0.05),其中1个miRNA表达水平上调,18个miRNAs表达水平下调。借助于miRNA靶基因预测网站对19个差异表达miRNAs靶基因进行预测,共得到潜在靶基因919个。分别对表达上调和下调的两组差异表达miRNAs及其靶基因进行调控网络图的绘制和DAVID功能注释,结果提示上调组miRNA分别参与了3个KEGG通路和17个基因本体论(GO)_生物学过程(BP)、5个GO_细胞组分(CC)、9个GO_分子功能(MF)注释条目(P<0.05),下调组miRNAs分别参与了13个KEGG通路和73个GO_BP、18个GO_CC、30个GO_MF注释条目(P<0.05)。结论肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱系与健康对照具有显著差异。借助高通量组学和相关数据库的联合运用,对内脏脂肪细胞及其功能作用有了更深入的了解,并为肥胖及肥胖相关疾病的发病机制研究提供了新的视角。

关 键 词：肥胖  内脏脂肪 外泌体 MIRNAS 功能注释

分 类 号：R394]