期刊文章详细信息
四川省鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型及地区分布研究
CRISPR genotyping and regional distribution of Yersinia pestis in Sichuan Province,China
文献类型:期刊文章
QI Teng;LIANG Ying;LI Wei;YANG Jun;LUO Long-ze;DUAN Feng-gang;WANG Li-mao;LI Fan;JIN Zhong-qiang;TAN Wen-ming;XIE Fei;WANG Hong;DAO Ji;LIU Jian;ZENG Lin-zi;LIAO Hong-yu;LEI Gao-peng(Sichuan Center for Disease Control and Prevention,Chengdu 610041,China;China Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China;Ganzi Tibeian Autonomous Prefecture Center for Disease Control and Prevention,Kangding 626000,China;Shiqu Center for Disease Control and Prevention,Shiqu 627350,China;Dege Center for Disease Control and Prevention,Dege 627250,China;Litang Center for Disease Control and Prevention,Litang 624300,China;Batang Center for Disease Control and Prevention,Batang 627650,China)
机构地区:[1]四川省疾病预防控制中心,成都610041 [2]中国疾病预防控制中心,北京102206 [3]甘孜州疾病预防控制中心,康定626000 [4]石渠县疾病预防控制中心,石渠627350 [5]德格县疾病预防控制中心,德格627250 [6]理塘县疾病预防控制中心,理塘624300 [7]巴塘县疾病预防控制中心,巴塘627650
基 金:四川省卫计委课题(No.16PJ397)资助~~
年 份:2018
卷 号:34
期 号:9
起止页码:801-804
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的对四川省鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)做规律成簇的间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats CRSIPR)基因分型和地区分布研究,为四川鼠疫防治提供科学依据。方法对132株鼠疫菌培养和提取核酸,应用3对CRISPR引物对被试菌株DNA进行PCR扩增、测序和分析,确定四川省鼠疫菌的CRSIPR基因型。结果 132株鼠疫菌共发现17种spacer,包括YPa 9种、YPb 5种、YPc 3种,新发现的1种space阵列。所有鼠疫菌株被分为2个CRISPR基因簇(Cc3′,Ca7),3个基因型(37′型、22型和sc01型)。其中石渠县青海田鼠型菌株基因型为37′型,石渠县人间鼠疫的菌株为22型,德格县旱獭型菌株基因型为22型,巴塘县、理塘县、雅江县和新龙县旱獭菌株基因型为sc01型。结论四川省鼠疫菌菌株具有明显的地区分布特征。
关 键 词:鼠疫 四川省 CRISPR 分子分型
分 类 号:Q786] S855.2]
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