文献类型：期刊文章

作　　者：郭玉倩[1] 角建林[2] 袁鑫[3] 吴超[1] 王利梅[1] 郑红[1]

GUO Yuqian;JIAO Jianlin;YUAN Xin;WU Chao;WANG Limei;ZHENG Hong(Department of Laboratory Animal Science,Kunming Medical University,Kunming 650500,China;Technology Transfer Centers,Kunming Medical University,Kunming 650031;The First Affiliated Hospital,Kunming Medical University,Kunming 650032)

机构地区：[1]昆明医科大学实验动物学部,昆明650500 [2]昆明医科大学技术转移中心,昆明650031 [3]昆明医科大学第一附属医院,昆明650032

出　　处：《中国比较医学杂志》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(编号:81460647);云南省应用基础研究计划项目(编号:2017FE468-014;2017FE468016);云南省教育厅科学研究基金项目(编号:2018Y048)

年　　份：2018

卷　　号：28

期　　号：9

起止页码：7-13

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成。方法采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16Sr DNA通用引物扩增V3~V4区,采用Illumina PE250平台测序。结果共获得160 157条有效序列,聚类后得437个运算分类单位(operational taxonomic units,OTUs)。树鼩大肠中的细菌有9个门、19个纲、37个目、68个科、137个属和194个种。其中,(1)厚壁菌门和变形菌门的丰度最高,分别为63.30%和28.52%;(2)优势纲是芽孢杆菌纲和γ-变形菌纲(51.46%、28.02%);(3)乳杆菌目和肠杆菌目的丰度最高,为45.33%和27.51%;(4)优势科是乳杆菌科(35.30%)和肠杆菌科(27.51%);(5)乳杆菌属和埃希氏菌属为优势属(35.30%、27.49%);(6)在种的水平,可培养细菌的丰度为37.10%,未分类细菌27.69%,不可培养细菌35.21%。可培养细菌中,唾液链球菌的丰度最高(26.66%)。在丰度最高的20个种中,8种细菌(40%)未分类,为以往未被发现的新种。个体间细菌群落存在一定差异。结论树鼩大肠内容物中的细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究。

关 键 词：树鼩 大肠细菌  ILLUMINA PE250  多样性

分 类 号：R-33]