期刊文章详细信息
柑橘品种鉴定的SSR标记开发和指纹图谱库构建
SSR Markers Screening for Identification of Citrus Cultivar and Construction of DNA Fingerprinting Library
文献类型:期刊文章
LI Yi;MA XianFeng;TANG Hao;LI Na;JIANG Dong;LONG GuiYou;LI DaZhi;NIU Ying;HAN RuiXi;DENG ZiNiu(College of Horticulture and Landscape,Hunan Agricultural University,Changsha 410128;Development Center for Science and Technology,Ministry of Agriculture,Beijing 100122;Institute of Citrus Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Chongqing 400712;Guangxi Academy of Specialty Crops,Guilin 541004,Guangxi)
机构地区:[1]湖南农业大学园艺园林学院,长沙410128 [2]农业部科技发展中心,北京100122 [3]中国农业科学院柑桔研究所,重庆400712 [4]广西特色作物研究院,广西桂林541004
基 金:国家自然科学基金(31720103915);2018年农产品质量安全监管专项(111721301092361007);广西柑橘新品种选育及无病毒苗木繁殖研究特聘专家岗位
年 份:2018
卷 号:51
期 号:15
起止页码:2969-2979
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、FSTA、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:【目的】筛选出一套SSR核心引物,用于构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,为柑橘种苗认证、品种登记和植物新品种保护提供技术支撑。【方法】以柑橘属8个主要栽培种类为试材进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,筛选出多态性丰富、扩增条带稳定的引物对部分参试品种进行PCR扩增,扩增产物通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行进一步的引物筛选;筛选得到的引物进行荧光标记,并选用部分柑橘品种进行PCR扩增,扩增产物利用基因分析仪检测,分别计算各引物的PIC值、等位基因数目,选取一套多态性丰富的适合进行荧光毛细管电泳检测的SSR引物组合,进而对所有参试品种进行分析,构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,同时利用筛选的SSR标记对参试品种进行鉴定。【结果】初期以柑橘属8个种的代表品种(太田椪柑、沙田柚、沅江酸橙、大红甜橙、邓肯葡萄柚、枸橼、费米耐劳柠檬和墨西哥来檬)为材料,用362对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经4%琼脂糖凝胶电泳检测,初步筛选出80对种间多态性高、扩增稳定的SSR引物;进一步从8个种类里选择不同类型的64个柑橘品种,用上述筛选出的80对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,再筛选出60对品种类型间多态性高、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并分别进行荧光标记;另以168份柑橘品种为材料对上述60对SSR引物进行PCR扩增,经荧光毛细管电泳检测,依据各引物的PIC值、等位基因数目、峰图读取难易程度、扩增稳定性及染色体位置等,最终筛选出21对SSR引物作为指纹图谱库构建的核心引物。为消除不同仪器、不同试验批次等引起的误差,为21对SSR引物各主要等位变异选择相应的参照品种。根据各引物标记的荧光颜色及扩增片段大小进行合理组合,21对SSR引物可分成5组进行多重电泳,共采集500份柑橘品种的DN
关 键 词:柑橘 SSR 毛细管电泳 品种鉴定 DNA指纹图谱库
分 类 号:S666]
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