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基于线粒体DNA D-loop序列的黄斑篮子鱼群体遗传多样性分析
Genetic variations among Siganus oramin populations in coastal waters of southeast China based on mtDNA control region sequences
文献类型:期刊文章
HUANG Xiaolin;LI Wenjun;LIN Heizhao;YANG Yukai;LI Tao;YU Wei;HUANG Zhong(Guangdong Provincial Key Laboratory of Fishery Ecology and Environment;South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fisheries Sciences,Guangzhou 510300,China;Shenzhen Base of South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Shenzhen 518121,China)
机构地区:[1]中国水产科学研究院南海水产研究所,广东省渔业生态环境重点实验室,广东广州510300 [2]中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地,广东深圳518121
基 金:广东省渔港建设与渔业发展专项海洋渔业科技推广方向.科技攻关与研发项目(A201601B10);广东省渔业生态环境重点实验室开放基金资助(FEEL-2017-13);深圳市科技计划知识创新基础研究项目(JCYJ20170817103922921、JCYJ20170817103856495);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2016TS01)
年 份:2018
卷 号:37
期 号:4
起止页码:45-51
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:对中国华南沿海不同地理群体的黄斑篮子鱼(Siganus oramin)进行遗传多样性分析,测定了漳州东山湾(DS)、深圳大亚湾(DY)、深圳大鹏湾(DP)、阳江沙扒湾(SB)4个群体共计100尾黄斑篮子鱼线粒体DNA D-loop序列。结果显示:序列长度约828bp,包含72个变异位点,50个单倍型,A、T、C、G含量平均为31.2%、31.1%、20.8%和16.9%;单倍型多样性指数为0.893±0.053~0.957±0.030,核苷酸多样性指数为0.0105±0.0031~0.0179±0.0031,表现为高单倍型多样性而低核苷酸多样性的特点;群体内的遗传距离0.0107~0.0184,群体间的遗传距离0.0112~0.0172,AMOVA分析显示群体间的分子变异占0.66%,群体内占99.34%;中性检验结果表明Fu’s Fs检验值为显著的负值(-16.7079,p<0.01);核苷酸不配对分布图呈单峰,表明黄斑篮子鱼演化过程中经历过种群扩张事件,推测扩张时间约在1.38~4.60万年前。综上,华南沿海岸4个黄斑篮子鱼群体间不存在显著的遗传分化,可划归一个管理单元,而沙扒湾(SB)群体遗传多样性水平相对较高,应优先加以保护。
关 键 词:线粒体DNA D-LOOP 黄斑篮子鱼 群体遗传多样性
分 类 号:P735.541]
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