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夏南牛与13个黄牛群体mtDNA及微卫星DNA遗传多样性比较研究
Comparison of Genetic Diversity between Xianan and Other 13 Cattle Populations based on mtDNA D-loop and Microsatellite DNA
文献类型:期刊文章
WANG Yanhuan;WU Hui;FANG Xingtang;CHEN Hong;ZHANG Chunlei(School of Life Sciences,Institute of Molecular and Celluar Biology,Jiangsu Normal University,Xuzhou,Jiangsu 221116,China)
机构地区:[1]江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院,江苏徐州221116
基 金:国家自然科学基金项目(31772558;31472077)
年 份:2018
卷 号:39
期 号:3
起止页码:17-23
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用mtDNA和微卫星DNA两种标记方法,对夏南牛与13个黄牛群体的179个个体进行遗传多样性和群体间的亲缘关系及母系起源分析。通过测定14个黄牛群体179条mtDNA D-loop区序列,共发现124个变异位点和60种单倍型,表明14个黄牛群体具有丰富的遗传多样性。夏南牛群体mtDNA D-loop区序列共发现49个变异位点和7种单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.732±0.017,其单倍型多样度较中国地方牛种低,中国黄牛具有更丰富的遗传多样性。通过测定9个具有高度多态性的微卫星座位的等位基因数(Na)、平均杂合度(H)和多态信息含量(PIC),表明9个微卫星位点在60个夏南牛个体中共发现47个等位基因,平均每个位点的有效等位基因数为1.229~6.584。总群体的PIC和H分别为0.608~0.798和0.695~0.837,夏南牛的PIC和H分别为0.692和0.715,夏南牛的遗传多样性较中国黄牛低,中国黄牛群体的遗传多样性高于外来牛种,这一结果和群体间mtDNA D-loop区研究结果一致。构建的NJ系统进化树显示14个黄牛群体主要起源于普通牛和瘤牛,夏南牛受瘤牛的影响更大,具有瘤牛和普通牛的种质特征。本研究为夏南牛遗传资源的保护、合理利用和选育改良提供了理论依据。
关 键 词:夏南牛 MTDNA D-LOOP 微卫星DNA 遗传多样性 母系起源
分 类 号:S811.5]
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