期刊文章详细信息
全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL
Genome-wide Association Study of Grain Appearance and Milling Quality in a Worldwide Collection of Indica Rice Germplasm
文献类型:期刊文章
FANG Ya-Jie;ZHU Ya-Jun;WU Zhi-Chao;CHEN Kai;SHEN Cong-Cong;SHI Ying-Yao;XU Jian-Long(Anhui Agricultural University,Hefei230036,Anhui,China;Institute of Crop Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing100081,China;Agricultural Genomics Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Shenzhen518210,Guangdong,China;Shenzhen Institute of Breeding & Innovation,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Shenzhen518120,Guangdong,China)
机构地区:[1]安徽农业大学,安徽合肥230036 [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [3]中国农业科学院农业基因组研究所,广东深圳518210 [4]中国农业科学院深圳生物育种创新研究院,广东深圳518210
基 金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014AA10A601);农业部引进国际先进农业科学技术(948)项目(2016-X16);深圳孔雀团队计划(20130415095710361);中国农业科学院科技创新工程团队项目资助~~
年 份:2018
卷 号:44
期 号:1
起止页码:32-42
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(q MRR9、q GL2、q GL10、q GW1、q GLWR1和q GLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果,我们推论q SW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。
关 键 词:籼稻种质资源 外观与加工品质 全基因组关联分析 数量性状座位
分 类 号:S511.21]
参考文献:
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同被引文献:
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