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期刊文章详细信息

全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL    

Genome-wide Association Study of Grain Appearance and Milling Quality in a Worldwide Collection of Indica Rice Germplasm

  

文献类型:期刊文章

作  者:方雅洁[1,2] 朱亚军[3] 吴志超[2] 陈凯[3] 申聪聪[3] 石英尧[1] 徐建龙[2,3,4]

FANG Ya-Jie;ZHU Ya-Jun;WU Zhi-Chao;CHEN Kai;SHEN Cong-Cong;SHI Ying-Yao;XU Jian-Long(Anhui Agricultural University,Hefei230036,Anhui,China;Institute of Crop Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing100081,China;Agricultural Genomics Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Shenzhen518210,Guangdong,China;Shenzhen Institute of Breeding & Innovation,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Shenzhen518120,Guangdong,China)

机构地区:[1]安徽农业大学,安徽合肥230036 [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [3]中国农业科学院农业基因组研究所,广东深圳518210 [4]中国农业科学院深圳生物育种创新研究院,广东深圳518210

出  处:《作物学报》

基  金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014AA10A601);农业部引进国际先进农业科学技术(948)项目(2016-X16);深圳孔雀团队计划(20130415095710361);中国农业科学院科技创新工程团队项目资助~~

年  份:2018

卷  号:44

期  号:1

起止页码:32-42

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型,利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析,挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明,粒形和籼米的外观和加工品质密切相关,垩白性状降低稻米的精米率和整精米率,除粒形外,籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL,其中17个为新位点,6个新位点(q MRR9、q GL2、q GL10、q GW1、q GLWR1和q GLWR2.1)在2个环境下均被检测到,暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外,21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果,我们推论q SW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因,以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。

关 键 词:籼稻种质资源  外观与加工品质  全基因组关联分析 数量性状座位

分 类 号:S511.21]

参考文献:

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同被引文献:

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