期刊文章详细信息
利用水稻MAGIC群体关联定位抽穗期和株高QTL
Mapping of QTLs for Heading Date and Plant Height Using MAGIC Populations of Rice
文献类型:期刊文章
SHEN Cong-Cong;ZHU Ya-Jun;CHEN Kai;CHEN Hui-Zhen;WU Zhi-Chao;MENG Li-Jun;XU Jian-Long(Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China;Agricultural Genomics Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen 518210, China;Pingxiang Institute of Agricultural Science, Pingxiang 337000, China;Shenzhen Institute of Breeding & Innovation, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen 518120, China)
机构地区:[1]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [2]中国农业科学院农业基因组研究所,广东深圳518210 [3]江西省萍乡市农业科学研究所,江西萍乡337000 [4]中国农业科学院深圳生物育种创新研究院,广东深圳518210
基 金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014AA10A601);农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(2016-X16);深圳孔雀团队计划(20130415095710361);中国农业科学院科技创新工程团队项目资助~~
年 份:2017
卷 号:43
期 号:11
起止页码:1611-1621
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EBSCO、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:利用多亲本高代互交系(multi-parent advanced generation inter-cross,MAGIC)群体(DC1、DC2和8way)及其复合群体DC12(DC1+DC2)和RMPRIL(DC1+DC2+8way)进行关联分析定位水稻抽穗期和株高QTL。2015年和2016年分别在江西和深圳收集3个MAGIC群体抽穗期数据,2016年在两地收集株高数据,结合Rice 55K SNP芯片进行基因分型,利用关联分析方法检测到3个影响抽穗期的主效QTL(q HD3、q HD6和q HD8),分别位于第3、第6和第8染色体,且分别与已知抽穗期基因DTH3、Hd3a和Ghd8在同一区域。检测到5个影响株高的QTL(q PH1.1、q PH1.2、q PH1.3、q PH4和q PH6),其中q PH1.1和q PH1.2位于已知基因Psd1和sd1附近,其余3个QTL为影响株高的新位点,但仅在1个群体和单个环境下被检测到,QTL表达受遗传背景和环境影响大。不同MAGIC群体定位抽穗期和株高的效果不同,在8亲本MAGIC群体8way及复合群体DC12和RMPRIL分别检测到5、5和6个抽穗期和株高QTL,明显多于4亲本群体DC1的2个和DC2的4个,而且作图的精度更高,表现在定位到的QTL显著水平高和与已知基因距离更近,尤其是复合群体的联合分析(如DC12和RMPRIL)的作图优势更为明显。
关 键 词:水稻 MAGIC群体 抽穗期 株高 关联分析 QTL
分 类 号:S511]
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