文献类型：期刊文章

作　　者：彭彬[1] 张雪[1] 曹帆帆[1] 王莹[1] 孙家兰[2] 江梅[2] 李龙宣[2]

PENG Bin;ZHANG Xue;CAO Fanfan;WANG Ying;SUN Jialan;JIANG Mei;LI Longxuan(Department of Neurology,Shanghai Gongli Hospital, the Second Military Medical University, Shanghai 200135, China)

机构地区：[1]上海市浦东新区公利医院&第二军医大学附属公利医院中法合作中心实验室,200135 [2]上海市浦东新区公利医院&第二军医大学附属公利医院神经科,200135

出　　处：《中国神经免疫学和神经病学杂志》

基　　金：国家自然科学基金面上项目(81571203);上海市自然科学基金项目(15ZR1437200);上海市浦东新区卫生系统领先人才培养计划(PWR12014-05);上海市医学重点专科建设计划项目(ZK2015B16);上海市卫计委科研项目(201540394);上海市卫生计生系统优秀学科带头人(百人计划)(2017BR051)

年　　份：2017

卷　　号：24

期　　号：5

起止页码：318-323

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的分析缺血性脑卒中(IS)患者恢复稳定期外周血单个核细胞(PBMCs)中的差异表达基因,为探讨脑卒中恢复稳定期的遗传病理机制提供生物信息学线索。方法选择GEO数据库中GDS4521芯片数据,该芯片以年龄、性别相匹配的20例IS恢复稳定期(脑卒中发生至少6个月以上)患者和20例未发生过脑卒中者作为研究对象,收集其PBMCs进行基因芯片检测,利用GEO2R、DAVID、g:profiler和String等工具,筛选和分析差异表达基因功能富集和相关信号通路情况。结果脑卒中恢复稳定期组与对照组相比,在PBMCs中发现37个基因表达明显变化,其中34个上升,3个下降。GO分析表明,这些差异表达基因在生物过程方面,以炎性反应、中性粒细胞趋化相关基因为最多;在分子功能方面,以趋化因子活性相关基因为最多。KEGG信号通路分析表明,位于TNF信号通路中的差异表达基因数量最多。相互作用网络图揭示,这些差异基因主要以与炎性反应相关的两个网络为主。结论 IS发生超过6个月后仍有多种功能蛋白和信号通路可能发生改变,特别是与炎性反应相关的蛋白和信号通路,提示炎性反应在IS的恢复稳定期仍可能对疾病的预后和再发起作用。

关 键 词：缺血性卒中 生物信息学 基因芯片 差异表达基因

分 类 号：R743.3]