文献类型：期刊文章

作　　者：杨铭[1,2] 于洋[1] 张晓军[1] 王全超[1,3] 刘敬文[1,3] 李富花[1] 相建海[1]

YANG Ming;YU Yang;ZHANG Xiao-jun;WANG Quan-chao;LIU Jing-wen;LI Fu-hua;XIANG Jian-hai(Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences,Qingdao 266071, China;Oceanic & Fishery Technology Center of Fuzhou, Fuzhou 350005, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China)

机构地区：[1]中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室,山东青岛266071 [2]福州市海洋与渔业技术中心,福建福州350005 [3]中国科学院大学,北京100049

出　　处：《海洋科学》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31502161,31672632);国家“863”高技术研究发展计划资助项目(2012AA10A404)~~

年　　份：2017

卷　　号：41

期　　号：2

起止页码：96-102

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：对虾遗传多样性和育种研究需要大量的分子标记。作者利用凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)转录组测序数据,采用MISA软件进行微卫星序列挖掘,共获得14 767条微卫星序列。统计发现在凡纳滨对虾中微卫星出现的频率为16.76%;在所有的微卫星序列中,2碱基微卫星最多,占59.53%;其次是3碱基微卫星,占35.78%。随机选取其中74条序列设计引物,通过DNA混池扩增和分型的方法进行微卫星标记的开发,PCR扩增的显示有54对(72.97%)能扩增出清晰的目的条带,进一步分型的结果显示27条(36.49%)微卫星显示出多态性,从这些多态性的微卫星位点中选择11个位点在"科海1号"种质库材料中进行个体分型,结果显示在该群体中微卫星标记的等位基因数目为2~11个不等,期望杂合度值为0.256~0.858,观察杂合度为0.213~0.875,多态性信息含量为0.221~0.830,在11个位点中有4个位点显著偏离HWE(P<0.05)。本研究结果为后续使用微卫星标记进行对虾遗传学研究,促进对虾的遗传选育和种质资源保护提供了重要基础。

关 键 词：凡纳滨对虾(Litopenaeus  vannamei)  微卫星 转录组 遗传多样性  

分 类 号：S917.4[水产类]