期刊文章详细信息
基于虚拟筛选发现4-羟基喹啉类新型IDO1抑制剂
Discovery of novel 4-hydroxyquinolines as indoleamine 2,3-dioxygenase 1 inhibitors by virtual screening
文献类型:期刊文章
ZHANG Yuping;SHAN Changyu;GUO Haiqiong;LI Hongwei;OUYANG Qin;WANG Yuanqiang(Chongqing Key Laboratory of Medicinal Chemistry and Molecular Pharmacology,College of Pharmacy and Bioengineering,Chongqing University of Technology,Chongqing,400054;Department of Medicinal Chemistry,Faculty of Pharmacy&Laboratory Medicine,Army Medical University(Third Military Medical University),Chongqing,400038,China)
机构地区:[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,药物化学与分子药理学重庆市重点实验室,重庆400054 [2]陆军军医大学(第三军医大学)药学与检验医学系药物化学教研室,重庆400038
年 份:2019
卷 号:41
期 号:16
起止页码:1601-1610
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的采用药效团模型和分子对接方法对ZINC、Chembridge数据库进行虚拟筛选,并通过酶活性测试进行验证,以发现新骨架结构的IDO1抑制剂。方法通过分子对接方法靶向IDO1酶活性位点,对ZINC数据库进行虚拟筛选,得到苗头化合物,进行酶活性测试,发现酶活性较好的先导化合物;随后用已进入临床研究的3个IDO1抑制剂构建药效团模型,以此模型对先导化合物类似物进行虚拟筛选,并测定化合物的抑酶活性;通过分子动力学模拟探究化合物与IDO1的结合模式。结果通过分子对接方法对超过200万个虚拟化合物进行筛选得到11个先导化合物并测酶活性,其中ZINC91657208抑酶活性较好,IC50约为77.15μmol/L,活性骨架为4-羟基喹啉。亚结构检索4-羟基喹啉的结构得到31个类似物,利用药效团虚拟筛选出10个化合物,并测酶活性,其中3个4-羟基喹啉类化合物均具有明显的抑酶活性,而Chembridge29374490为酶活性最好的IDO1抑制剂,其IC50约为37.78μmol/L。经分子动力学模拟平衡后,其骨架原子均方差偏根(root mean square deviation, RMSD)分别为1?和2.4?。结论从ZINC和Chembridge数据库中发现了新型4-羟基喹啉类IDO1抑制剂。
关 键 词:IDO1抑制剂 分子对接 IDO1酶活性 药效团筛选 分子动力学模拟
分 类 号:R91[药学类]
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