文献类型：期刊文章

作　　者：吴晓明[1] 宋长新[1] 王波[1] 程敬之[2]

机构地区：[1]西安交通大学生命科学与技术学院生物信息学研究中心,西安710049 [2]西安交通大学生命科学与技术学院生物医学工程系,西安710049

出　　处：《生物医学工程学杂志》

年　　份：2002

卷　　号：19

期　　号：3

起止页码：455-458

语　　种：中文

收录情况：AJ、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EI、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：隐马尔可夫模型 (Hidden Markov model,HMM)用于蛋白质研究是生物信息学研究的新领域。目前 ,人们已经得到大量的蛋白质序列和结构数据 ,传统研究蛋白质的方法已经不再实用 ,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来进行研究。隐马尔可夫模型可以通过训练 ,识别同一特征的蛋白质序列。从 SCOP数据库中选择了一个蛋白质族 ,由它得到了能够代表该族特征的隐马尔可夫模型 ,并用该模型对一些蛋白质序列进行分析。结果表明 ,HMM能够较好的表示同一族的蛋白质 。

关 键 词：隐马尔可夫模型 SCOP数据库  蛋白质分类  序列分析  

分 类 号：Q51]