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非洲型寨卡病毒实时荧光定量PCR检测技术的建立
Establishment of real-time fluorescence-based quantitative PCR to detect African genotype Zika virus
文献类型:期刊文章
CHEN Jia-wen;QIN Zhi-ran;PENG Shu-ying;YU Jian-hai;HE Xiao-en;XIE Qian;ZHU Li;XIAO Wei-wei;ZHAO Wei(Biosafety level 3 Laboratory,School of Public Health,Southern Medical University,Guangzhou,Guangdong 510515,China)
机构地区:[1]南方医科大学公共卫生学院三级生物安全实验室,广东广州510515
基 金:国家自然科学基金(No.31470271;81730110)
年 份:2018
卷 号:45
期 号:22
起止页码:4135-4138
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、IC、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的建立非洲型寨卡病毒(ZIKV)实时荧光定量PCR检测技术。方法人工合成非洲型ZIKV E基因上2 074~2 210 bp的保守片段,克隆到pUC57载体作为非洲型ZIKV质粒标准品;以108~102 copies/μl共7组质粒标准品制作标准曲线;设计的上游引物为5'-TCAAAGATGATGTTGGAGCT-3'、下游引物5'-CCTCTCACAGTGGCYTCA-3'、探针5'FAM-CCACCATTTGGGGATTCTTACATTGTC-BQ1-3',采用实时荧光定量PCR检测其特异性、灵敏度及重复性。结果非洲型ZIKV质粒标准品浓度为76.61 ng/μl;以非洲型ZIKV质粒标准品制作标准曲线,在2.47×(108~102)copies/μl之间有较好线性关系,Rsq为1;能特异检测出非洲型ZIKV质粒标准品,与登革病毒1~4、亚洲型ZIKV质粒标准品、HCV-1b病人血清RNA无交叉反应,检测限为2.47×101copies/μl。结论本研究建立了可用于非洲型ZIKV实验室检测的实时荧光定量PCR技术。
关 键 词:非洲型寨卡病毒 实时荧光定量PCR E基因
分 类 号:R183.5]
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