文献类型：期刊文章

作　　者：金名捺[1] 潘英华[2] 丘式浚[1] 严维[1] 邓汉超[1] 陈慧[1] 梁云涛[2]

JIN Ming-na;PAN Ying-hua;QIU Shi-jun;YAN Wei;DENG Han-chao;CHEN Hui;LIANG Yun-tao(Shenzhen Institute of Molecular Crop Design/Shenzhen Key Laboratory of Molecular Design Breeding,Shenzhen Guangdong 518107;Rice Research Institute of Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Guangxi Key Laboratory of Rice Genetics and Breeding,Nanning 530007)

机构地区：[1]深圳市作物分子设计育种研究院/深圳市分子设计育种重点实验室,深圳广东518107 [2]广西壮族自治区农业科学院水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室,南宁530007

出　　处：《植物遗传资源学报》

基　　金：国家科技资源共享服务平台项目(NICGR2017-39);广西壮族自治区主席科技资金项目(1517-03);广西农业科学院基本科研业务专项项目(2015YT14)

年　　份：2018

卷　　号：19

期　　号：6

起止页码：1055-1063

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：植物中广泛分布着单核苷酸多态性(SNP)位点。在此基础上发展而来的SNP标记因其具有高分辨率和共显性等优点,已成为当前作物遗传研究重要的分子工具。本研究拟建立基于高分辨率熔解曲线(HRM)技术的SNP分子标记,从而实现对栽培稻和野生稻的高效基因分型,为今后水稻的基因挖掘、品种鉴定以及分子育种等提供可靠、快捷的技术工具。利用水稻全基因组9 K SNP芯片对栽培稻品种黄华占和野生稻Y605进行扫描,寻找两者之间的SNP位点,并将其开发成基于HRM技术的特异分子标记。然后,利用这些分子标记对亲本黄华占、野生稻Y605以及两者的BC3回交群体进行分子检测,以验证其有效性。水稻9 K基因芯片在黄华占与野生稻Y605之间总共找到了4198个SNP位点,它们在12条染色体上较均匀分布。在水稻第1号染色体上随机挑选出5个SNP位点开发成基于HRM技术的特异分子标记。利用这些标记对黄华占与野生稻Y605的BC3F1和BC3F2群体进行检测分析,发现它们都能准确区分亲本的纯合与杂合基因型。并且,在回交后代的第1号染色体ZY1-1~ZY1-4标记区间检测到野生稻片段插入。水稻全基因组9 K SNP芯片可以很好地应用于水稻SNP标记的开发。开发的SNP特异标记能准确、高效地对栽培稻和野生稻进行基因分型。进一步完成基于HRM技术的水稻全基因组SNP标记的开发,可为今后野生稻的分子遗传研究、有利基因挖掘和育种应用提供高效的分子检测手段。

关 键 词：HRM技术  水稻基因组SNP芯片  分子标记 野生稻 有利基因挖掘  

分 类 号：S511]