文献类型：期刊文章

作　　者：王忠伟[1] 何彦[2] 曾念宜[2] 唐文丽[3] 周宏伟[2]

Wang Zhongwei;He Yan;Zeng Nianyi;Tang Wenli;Zhou Hongwei(Department of Environmental Health,School of Public Health,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China)

机构地区：[1]南方医科大学公共卫生学院环境卫生学系,广州510515 [2]南方医科大学珠江医院检验医学部 [3]深圳市返璞生物科技有限公司

出　　处：《中华检验医学杂志》

基　　金：国家自然科学基金优秀青年基金（31322003）

年　　份：2018

卷　　号：41

期　　号：10

起止页码：734-741

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的识别不同地区炎症性肠病（IBD）患者肠道菌群生物标志物，建立预测模型，并探索其菌群功能变化特征。方法收集中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、德国、印度和立陶宛6个队列1 510例IBD患者和496名健康对照（HC）16 srRNA基因序列。使用微生物组分析软件QIIME（v1.9.1）分析肠道菌群组成和多样性指标，使用微生物多样性分析软件LEfSe比较IBD患者与健康对照有统计学差异的肠菌标志物。随机森林法建立预测模型。PICRUSt预测菌群功能变化特征。结果IBD患者肠道菌群α多样性显著低于HC（Wilcoxon秩和检验，P〈0.05）。中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、立陶宛和德国队列IBD患者肠道菌群和HC菌差异具有统计学意义（Adonis，P〈0.05），而印度队列未发现统计学差异。LEfSe分析显示，中国和美国（RISK）队列IBD患者肠道菌群变化较为一致，而德国、立陶宛和印度IBD患者肠道菌群变化具有较强的本地化特征。肠球菌属（Enterococcus）在中国、美国（RISK）和德国队列IBD患者中显著增加，肠杆菌科（Enterobacteriaceae）在中国和美国（RISK）队列IBD患者肠道显著增加，瘤胃球菌属（Ruminococcus）在中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD患者肠道中显著减少。各国队列分别建模预测当地人群，受试者工作特征（ROC）曲线下面积（AUC）为（86.48±4.91）%。以其中任一队列模型预测其他队列，中国、美国（RISK）和美国（PRISM）相互间预测AUC较高，其他两者间预测AUC较低。全样本整体建模预测中国、美国（RISK）、美国（PRISM）、德国、立陶宛和印度队列，AUC依次为90.1%、82.3%、79.6%、61.9%、65.5%和54.2%。功能分析显示，中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD患者肠道菌群谷胱甘肽代谢水平明显升高，醌类在中国、美国（RISK）、美国（PRISM）和印度队列IBD

关 键 词：炎性肠疾病 胃肠道微生物组  生态失调 氧化性应激 预测  

分 类 号：R446.5] R574[临床医学类]