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期刊文章详细信息

基于二代测序技术分析多拷贝DYF404S1基因座遗传多态性初步研究    

A preliminary study on genetic polymorphisms of multi-copy DYF404S1 locus based on the next generation sequencing

  

文献类型:期刊文章

作  者:安雷雷[1,2] 郭利伟[1] 钱嘉林[3] 于春蕊[3] 赵晶[4] 严江伟[4] 焦会永[1] 黄艳梅[1,5]

An Leilei;Guo Liwei;Qian Jialin;Yu Chunrui;Zhao Jing;Yan Jiangwei;Jiao Huiyong;Huang Yanmei(Department of Forensic Genetics,School of Forensic Medicine,Xinxiang Medical University,Xinxiang 453003,China;Department of Anatomy of Sanquan College,Xinxiang Medical University,Xinxiang 453003,China;Beijing Center for Physical & Chemical Analysis,Beijing 100094,China;Beijing Institute of Genomics Chinese Academy of Sciences,Beijing,100029,China;Xinxiang Key Laboratory of Forensic Science Evidence,School of Forensic Medicine,Xinxiang Medical University,Xinxiang 453003,China)

机构地区:[1]新乡医学院法医学院法医物证学教研室,河南新乡453003 [2]新乡医学院三全学院人体解剖学教研室,河南新乡453003 [3]北京市理化分析测试中心,北京100094 [4]中国科学院北京基因组研究所,北京100029 [5]新乡医学院法医学院新乡市法庭科学证据重点实验室,河南新乡453003

出  处:《中国法医学杂志》

基  金:河南省教育厅自然科学基金资助项目13A310849;河南省教育科学"十二.五"规划立项重点课题2013-JKGHB-0035;新乡医学院培育基金重点项目2013ZD114

年  份:2018

卷  号:33

期  号:5

起止页码:485-488

语  种:中文

收录情况:CSCD、CSCD_E2017_2018、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的基于二代测序技术(next generation sequencing, NGS)用于Y染色体多拷贝短串联重复序列(multi-copy short tandem repeat on Y chromosome, Multi-copy Y-STRs)DYF404S1分型方法建立及在河南汉族群体中遗传多态性分析的初步研究。方法在DYF404S1基因座特异引物两端添加适宜的接头,得到带有不同接头的引物组合,共25组。采用BIOO RAPID DNA试剂盒构建二代测序文库,使用Illumina MiseqTM二代测序仪对225例河南汉族群体的男性样本进行测序,STRait Razor V2.0软件进行测序数据分析,同时与一代测序ABI3100遗传分析仪分型结果比对分析。结果基于Illumina MiseqTM二代测序平台,采用引物两端加接头的方法对225例河南汉族无关男性个体样本进行DYF404S1基因座分型,其中220例成功分型,成功率达97.8%;同时使用3130遗传分析仪进行DYF404S1基因座分型,分型结果与二代测序分型结果一致。3例样本出现等位基因异常分型,均表现为3等位基因模式。DYF404S1基因座在河南汉族群体中的单体型多样性(haplotype diversity, HD)和个体识别力(discrimination power, DP)分别为0.9356和0.9311。结论初步建立了NGS技术用于多拷贝DYF404S1分型方法,为法医学实践和群体遗传学提供了技术和理论基础。

关 键 词:法医物证学 多拷贝 DYF404S1基因座  Y染色体 二代测序技术  

分 类 号:D919[法医学类]

参考文献:

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同被引文献:

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