文献类型：期刊文章

作　　者：孔卫青[1] 杨金宏[1]

Kong Weiqing;Yang Jinhong(Shaanxi Key Laboratory of Sericulture,Ankang University,Ankang,72500)

机构地区：[1]安康学院陕西省蚕桑重点实验室

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：陕西省教育厅重点实验室科研计划项目(No.13JS003);陕西省青年科技新星项目(No.2013KJXX-96)共同资助

年　　份：2018

卷　　号：37

期　　号：10

起止页码：4334-4339

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：桑花叶萎缩类病毒（Mulberry mosaic dwarf viroid, MMDVd）是近些年发现的桑花叶型萎缩病的病原物,本研究利用Mfold等软件和保守序列分析了MMDVd的二级结构及其中存在的核酶,并进一步对类病毒和卫星RNA进行了聚类分析,以期解决其分类和进化地位。结果表明MMDVd的正链存在典型的锤头型核酶结构,自切割位点为AUC,负链存在有疑似发夹型核酶的二级结构,是目前发现的第四个发夹核酶。聚类分析研究中,Pospiviroidae科类病毒单独形成一分支,Avsunviroidae科PLMVd和CChMVd首先与v LTSV聚合,而本研究MMDVd首先与卫星RNA s TRSV、s ArMV聚合,结合MMDVd正负链不同于已知Avsunviroidae科的两个锤头型核酶的结构,表明MMDVd应为一个新的未分类属,对于其核酶的自切割活性及其复制机制,则需要进一步的实验研究来验证。

关 键 词：桑花叶萎缩类病毒  锤头型核酶  发夹型核酶  聚类分析

分 类 号：S888.7]