期刊文章详细信息
人类CD4^+T细胞中核小体定位与DNA甲基化的分布特征研究
Research of distribution characteristics of nucleosome positioning and DNA methylation in human CD4^+T cells
文献类型:期刊文章
CUI Ying;LI Yan;WANG Hong-yan(Biomedical Engineering Room,College of Bioinformatics Science and Technology of Harbin Medical University,Harbin 150081,China;Computer Science and Technology School,North- east Normal University,Changchun 130024,China)
机构地区:[1]哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物医学工程教研室,黑龙江哈尔滨150081 [2]东北师范大学计算机学院,吉林长春130024
基 金:黑龙江省教育厅科研项目(12541565)
年 份:2018
卷 号:52
期 号:4
起止页码:318-321
语 种:中文
收录情况:CAS、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的研究人类CD4^+T细胞中核小体定位与DNA甲基化位点的分布特征,探讨二者的相关性以及在基因表达过程中的作用机制。方法通过生物信息学匹配算法及分析方法,采用Perl语言和R语言进行编程,使用SAM进行差异表达基因筛选,通过David软件进行功能注释,研究人类CD4^+T细胞中核小体定位和甲基化位点的分布特征以及二者在基因表达中的作用。结果研究发现人类基因组7个分区中,核小体的甲基化水平在激活状态时呈下降趋势,在甲基化核小体定位的甲基化水平发生了明显的改变,与核小体定位模式密切相关。结论核小体定位和甲基化在基因组定位上具有协同关系,在基因表达调控中发挥着重要作用。
关 键 词:CD4^+T细胞 核小体定位 DNA甲基化
分 类 号:Q811.4[生物工程类]
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